Gromacs
2018
Main Page
Modules
Other Docs
Namespaces
Classes
Files
Examples
File List
File Members
All
Functions
Variables
Typedefs
Enumerations
Enumerator
Macros
_
a
b
c
d
e
f
g
h
i
l
m
n
o
p
r
s
t
u
v
w
y
All
Classes
Namespaces
Files
Functions
Variables
Typedefs
Enumerations
Enumerator
Friends
Macros
Groups
Pages
Here is a list of all documented file members with links to the documentation:
- g -
ga2la_change_la() :
ga2la.h
ga2la_clear() :
ga2la.h
ga2la_del() :
ga2la.h
ga2la_get() :
ga2la.h
ga2la_get_home() :
ga2la.h
ga2la_init() :
ga2la.h
ga2la_is_home() :
ga2la.h
ga2la_set() :
ga2la.h
get_a_line() :
strdb.h
get_acffitfn() :
autocorr.h
get_acfnout() :
autocorr.h
get_center() :
groupcoord.h
get_center_comm() :
groupcoord.h
get_current_cuda_gpu_device_id() :
gpu_utils.h
get_gpu_device_info_string() :
gpu_utils.h
get_header() :
strdb.h
get_lines() :
strdb.h
get_nthreads_mpi() :
resourcedivision.h
get_pme_ddranks() :
domdec.h
get_pme_nnodes() :
domdec.h
get_pull_coord_value() :
pull.h
get_sum_of_positions() :
groupcoord.h
getCompatibleGpus() :
gpu_utils.h
getDeviceInfo() :
gpu_utils.h
getFilenm() :
filenm.h
getGpuCompatibilityDescription() :
gpu_utils.h
getGpuImplementationString() :
baseversion.h
gmx_abort() :
basenetwork.h
gmx_ana_index_check_range() :
indexutil.h
gmx_ana_index_check_sorted() :
indexutil.h
gmx_ana_index_clear() :
indexutil.h
gmx_ana_index_contains() :
indexutil.h
gmx_ana_index_copy() :
indexutil.h
gmx_ana_index_deinit() :
indexutil.h
gmx_ana_index_difference() :
indexutil.h
gmx_ana_index_difference_size() :
indexutil.h
gmx_ana_index_dump() :
indexutil.h
gmx_ana_index_equals() :
indexutil.h
gmx_ana_index_get_max_index() :
indexutil.h
gmx_ana_index_has_complete_elems() :
indexutil.h
gmx_ana_index_has_full_ablocks() :
indexutil.h
gmx_ana_index_has_full_blocks() :
indexutil.h
gmx_ana_index_init_simple() :
indexutil.h
gmx_ana_index_intersection() :
indexutil.h
gmx_ana_index_make_block() :
indexutil.h
gmx_ana_index_merge() :
indexutil.h
gmx_ana_index_partition() :
indexutil.h
gmx_ana_index_remove_duplicates() :
indexutil.h
gmx_ana_index_reserve() :
indexutil.h
gmx_ana_index_set() :
indexutil.h
gmx_ana_index_sort() :
indexutil.h
gmx_ana_index_squeeze() :
indexutil.h
gmx_ana_index_union() :
indexutil.h
gmx_ana_index_union_unsorted() :
indexutil.h
gmx_ana_indexgrps_extract() :
indexutil.h
gmx_ana_indexgrps_find() :
indexutil.h
gmx_ana_indexgrps_free() :
indexutil.h
gmx_ana_indexgrps_get_grp() :
indexutil.h
gmx_ana_indexgrps_init() :
indexutil.h
gmx_ana_indexgrps_is_empty() :
indexutil.h
gmx_ana_indexgrps_print() :
indexutil.h
gmx_ana_indexmap_clear() :
indexutil.h
gmx_ana_indexmap_copy() :
indexutil.h
gmx_ana_indexmap_deinit() :
indexutil.h
gmx_ana_indexmap_init() :
indexutil.h
gmx_ana_indexmap_init_orgid_group() :
indexutil.h
gmx_ana_indexmap_reserve() :
indexutil.h
gmx_ana_indexmap_set_static() :
indexutil.h
gmx_ana_indexmap_update() :
indexutil.h
gmx_ana_pos_add_to_group() :
position.h
gmx_ana_pos_append() :
position.h
gmx_ana_pos_append_finish() :
position.h
gmx_ana_pos_append_init() :
position.h
gmx_ana_pos_copy() :
position.h
gmx_ana_pos_empty() :
position.h
gmx_ana_pos_empty_init() :
position.h
gmx_ana_pos_init_const() :
position.h
gmx_ana_pos_reserve() :
position.h
gmx_ana_pos_reserve_for_append() :
position.h
gmx_ana_pos_reserve_forces() :
position.h
gmx_ana_pos_reserve_velocities() :
position.h
gmx_ana_pos_set_nr() :
position.h
GMX_ASSERT :
gmxassert.h
gmx_bitmask_t :
bitmask.h
gmx_bool :
basedefinitions.h
gmx_broadcast_world() :
basenetwork.h
GMX_CATCH_ALL_AND_EXIT_WITH_FATAL_ERROR :
exceptions.h
gmx_chdir() :
futil.h
gmx_check_thread_affinity_set() :
threadaffinity.h
gmx_ctime_r() :
sysinfo.h
GMX_CURRENT_FUNCTION :
current_function.h
GMX_CXX11_COMPILATION :
basedefinitions.h
gmx_cycles_calibrate() :
cyclecounter.h
gmx_cycles_have_counter() :
cyclecounter.h
gmx_cycles_read() :
cyclecounter.h
gmx_cycles_t :
cyclecounter.h
gmx_debug_at :
fatalerror.h
GMX_DEFAULT_CONSTRUCTORS :
classhelpers.h
gmx_disable_file_buffering() :
futil.h
GMX_DISALLOW_ASSIGN :
classhelpers.h
GMX_DISALLOW_COPY_AND_ASSIGN :
classhelpers.h
GMX_DOUBLE_EPS :
real.h
GMX_DOUBLE_MAX :
real.h
GMX_DOUBLE_MIN :
real.h
GMX_DOUBLE_NEGZERO :
real.h
gmx_edsam_t :
edsam.h
gmx_error :
fatalerror.h
gmx_error_handler_t :
fatalerror.h
gmx_exit_on_fatal_error() :
fatalerror.h
gmx_fatal() :
fatalerror.h
gmx_fatal_mpi_va() :
fatalerror.h
gmx_fatal_set_log_file() :
fatalerror.h
gmx_fexist() :
futil.h
gmx_ffclose() :
futil.h
gmx_ffopen() :
futil.h
gmx_fft_1d() :
fft.h
gmx_fft_1d_real() :
fft.h
gmx_fft_2d_real() :
fft.h
GMX_FFT_BACKWARD :
fft.h
gmx_fft_cleanup() :
fft.h
GMX_FFT_COMPLEX_TO_REAL :
fft.h
gmx_fft_destroy() :
fft.h
gmx_fft_direction :
fft.h
gmx_fft_flag :
fft.h
GMX_FFT_FLAG_CONSERVATIVE :
fft.h
GMX_FFT_FLAG_NONE :
fft.h
GMX_FFT_FORWARD :
fft.h
gmx_fft_init_1d() :
fft.h
gmx_fft_init_1d_real() :
fft.h
gmx_fft_init_2d_real() :
fft.h
gmx_fft_init_many_1d() :
fft.h
gmx_fft_init_many_1d_real() :
fft.h
gmx_fft_many_1d() :
fft.h
gmx_fft_many_1d_real() :
fft.h
GMX_FFT_REAL_TO_COMPLEX :
fft.h
gmx_fft_t :
fft.h
gmx_fft_transpose_2d() :
fft.h
gmx_file_copy() :
futil.h
gmx_file_rename() :
futil.h
GMX_FLOAT_EPS :
real.h
GMX_FLOAT_MAX :
real.h
GMX_FLOAT_MIN :
real.h
GMX_FLOAT_NEGZERO :
real.h
gmx_fopen_temporary() :
futil.h
gmx_format_current_time() :
sysinfo.h
gmx_fseek() :
futil.h
gmx_fsync() :
futil.h
gmx_ftell() :
futil.h
gmx_getcwd() :
futil.h
gmx_gethostname() :
sysinfo.h
gmx_getpid() :
sysinfo.h
gmx_getuid() :
sysinfo.h
gmx_getusername() :
sysinfo.h
gmx_host_alloc_t :
gpu_utils.h
gmx_host_free_t :
gpu_utils.h
GMX_IGNORE_RETURN_VALUE :
basedefinitions.h
gmx_init_debug() :
fatalerror.h
gmx_inline :
basedefinitions.h
gmx_int64_to_int() :
int64_to_int.h
gmx_is_double_precision() :
baseversion.h
gmx_is_single_precision() :
baseversion.h
gmx_lmcurve() :
gmx_lmcurve.h
GMX_LOG :
logger.h
GMX_MAKETABLES_14ONLY :
forcetable.h
GMX_MAKETABLES_FORCEUSER :
forcetable.h
gmx_many_fft_destroy() :
fft.h
gmx_mpi_initialized() :
basenetwork.h
GMX_MPI_REAL :
real.h
GMX_MPI_TEST :
mpitest.h
gmx_nbkernel_elec :
md_enums.h
gmx_nbkernel_elec_names :
md_enums.h
gmx_nbkernel_vdw :
md_enums.h
gmx_nbkernel_vdw_names :
md_enums.h
gmx_nblist_geometry_names :
md_enums.h
gmx_nblist_interaction_names :
md_enums.h
gmx_nblist_interaction_type :
md_enums.h
gmx_nblist_kernel_geometry :
md_enums.h
GMX_NO_WCMATCH :
cstringutil.h
gmx_node_num() :
basenetwork.h
gmx_node_rank() :
basenetwork.h
gmx_noreturn :
basedefinitions.h
gmx_off_t :
futil.h
gmx_omp_check_thread_affinity() :
gmxomp.h
gmx_omp_get_max_threads() :
gmxomp.h
gmx_omp_get_num_procs() :
gmxomp.h
gmx_omp_get_thread_num() :
gmxomp.h
gmx_omp_set_num_threads() :
gmxomp.h
GMX_PATH_MAX :
futil.h
gmx_pause() :
gmxomp.h
gmx_physicalnode_id_hash() :
basenetwork.h
gmx_pme_calc_energy() :
pme.h
gmx_pme_check_restrictions() :
pme.h
gmx_pme_destroy() :
pme.h
gmx_pme_do() :
pme.h
gmx_pme_init() :
pme.h
gmx_pme_receive_f() :
pme.h
gmx_pme_reinit_atoms() :
pme.h
gmx_pme_send_coordinates() :
pme.h
gmx_pme_send_finish() :
pme.h
gmx_pme_send_parameters() :
pme.h
gmx_pme_send_resetcounters() :
pme.h
GMX_PME_SPREAD :
pme.h
gmx_pmeonly() :
pme.h
gmx_qsort() :
qsort_threadsafe.h
gmx_qsort_threadsafe :
qsort_threadsafe.h
GMX_REAL_EPS :
real.h
gmx_real_fullprecision_pfmt :
real.h
GMX_REAL_MAX :
real.h
GMX_REAL_MAX_SIMD_WIDTH :
real.h
GMX_REAL_MIN :
real.h
GMX_REAL_NEGZERO :
real.h
GMX_RELEASE_ASSERT :
gmxassert.h
gmx_restrict :
basedefinitions.h
gmx_run_cmain() :
cmdlineinit.h
gmx_set_error_handler() :
fatalerror.h
gmx_set_max_backup_count() :
futil.h
gmx_set_nice() :
sysinfo.h
gmx_set_thread_affinity() :
threadaffinity.h
GMX_SIMD :
impl_reference_definitions.h
GMX_SIMD4_HAVE_DOUBLE :
impl_reference_definitions.h
GMX_SIMD4_HAVE_FLOAT :
impl_reference_definitions.h
GMX_SIMD4_HAVE_REAL :
simd.h
GMX_SIMD4_WIDTH :
impl_reference_definitions.h
GMX_SIMD_ALIGNMENT :
impl_reference_definitions.h
GMX_SIMD_DINT32_WIDTH :
impl_reference_definitions.h
GMX_SIMD_DOUBLE_WIDTH :
impl_reference_definitions.h
GMX_SIMD_FINT32_WIDTH :
impl_reference_definitions.h
GMX_SIMD_FLOAT_WIDTH :
impl_reference_definitions.h
GMX_SIMD_HAVE_4NSIMD_UTIL_DOUBLE :
impl_reference_definitions.h
GMX_SIMD_HAVE_4NSIMD_UTIL_FLOAT :
impl_reference_definitions.h
GMX_SIMD_HAVE_DINT32_ARITHMETICS :
impl_reference_definitions.h
GMX_SIMD_HAVE_DINT32_EXTRACT :
impl_reference_definitions.h
GMX_SIMD_HAVE_DINT32_LOGICAL :
impl_reference_definitions.h
GMX_SIMD_HAVE_DOUBLE :
impl_reference_definitions.h
GMX_SIMD_HAVE_FINT32_ARITHMETICS :
impl_reference_definitions.h
GMX_SIMD_HAVE_FINT32_EXTRACT :
impl_reference_definitions.h
GMX_SIMD_HAVE_FINT32_LOGICAL :
impl_reference_definitions.h
GMX_SIMD_HAVE_FLOAT :
impl_reference_definitions.h
GMX_SIMD_HAVE_FMA :
impl_reference_definitions.h
GMX_SIMD_HAVE_GATHER_LOADU_BYSIMDINT_TRANSPOSE_DOUBLE :
impl_reference_definitions.h
GMX_SIMD_HAVE_GATHER_LOADU_BYSIMDINT_TRANSPOSE_FLOAT :
impl_reference_definitions.h
GMX_SIMD_HAVE_GATHER_LOADU_BYSIMDINT_TRANSPOSE_REAL :
simd.h
GMX_SIMD_HAVE_HSIMD_UTIL_DOUBLE :
impl_reference_definitions.h
GMX_SIMD_HAVE_HSIMD_UTIL_FLOAT :
impl_reference_definitions.h
GMX_SIMD_HAVE_HSIMD_UTIL_REAL :
simd.h
GMX_SIMD_HAVE_INT32_ARITHMETICS :
simd.h
GMX_SIMD_HAVE_INT32_EXTRACT :
simd.h
GMX_SIMD_HAVE_INT32_LOGICAL :
simd.h
GMX_SIMD_HAVE_LOADU :
impl_reference_definitions.h
GMX_SIMD_HAVE_LOGICAL :
impl_reference_definitions.h
GMX_SIMD_HAVE_NATIVE_COPYSIGN_DOUBLE :
impl_reference_definitions.h
GMX_SIMD_HAVE_NATIVE_COPYSIGN_FLOAT :
impl_reference_definitions.h
GMX_SIMD_HAVE_NATIVE_EXP2_DOUBLE :
impl_reference_definitions.h
GMX_SIMD_HAVE_NATIVE_EXP2_FLOAT :
impl_reference_definitions.h
GMX_SIMD_HAVE_NATIVE_EXP_DOUBLE :
impl_reference_definitions.h
GMX_SIMD_HAVE_NATIVE_EXP_FLOAT :
impl_reference_definitions.h
GMX_SIMD_HAVE_NATIVE_LOG_DOUBLE :
impl_reference_definitions.h
GMX_SIMD_HAVE_NATIVE_LOG_FLOAT :
impl_reference_definitions.h
GMX_SIMD_HAVE_NATIVE_RCP_ITER_DOUBLE :
impl_reference_definitions.h
GMX_SIMD_HAVE_NATIVE_RCP_ITER_FLOAT :
impl_reference_definitions.h
GMX_SIMD_HAVE_NATIVE_RSQRT_ITER_DOUBLE :
impl_reference_definitions.h
GMX_SIMD_HAVE_NATIVE_RSQRT_ITER_FLOAT :
impl_reference_definitions.h
GMX_SIMD_HAVE_REAL :
simd.h
GMX_SIMD_HAVE_STOREU :
impl_reference_definitions.h
GMX_SIMD_RCP_BITS :
impl_reference_definitions.h
GMX_SIMD_REAL_WIDTH :
simd.h
GMX_SIMD_RSQRT_BITS :
impl_reference_definitions.h
gmx_stats_add_point() :
statistics.h
gmx_stats_add_points() :
statistics.h
gmx_stats_dump_xy() :
statistics.h
gmx_stats_free() :
statistics.h
gmx_stats_get_a() :
statistics.h
gmx_stats_get_ab() :
statistics.h
gmx_stats_get_ase() :
statistics.h
gmx_stats_get_average() :
statistics.h
gmx_stats_get_corr_coeff() :
statistics.h
gmx_stats_get_error() :
statistics.h
gmx_stats_get_npoints() :
statistics.h
gmx_stats_get_point() :
statistics.h
gmx_stats_get_rmsd() :
statistics.h
gmx_stats_get_sigma() :
statistics.h
gmx_stats_init() :
statistics.h
gmx_stats_make_histogram() :
statistics.h
gmx_stats_message() :
statistics.h
gmx_stats_remove_outliers() :
statistics.h
gmx_stats_t :
statistics.h
gmx_step_str() :
cstringutil.h
gmx_strcasecmp() :
cstringutil.h
gmx_strcasecmp_min() :
cstringutil.h
gmx_strdup() :
cstringutil.h
gmx_string_fullhash_func() :
cstringutil.h
gmx_string_hash_func() :
cstringutil.h
gmx_string_hash_init :
cstringutil.h
gmx_strncasecmp() :
cstringutil.h
gmx_strncasecmp_min() :
cstringutil.h
gmx_strndup() :
cstringutil.h
GMX_TEST_OPTIONS :
testoptions.h
GMX_THROW :
exceptions.h
GMX_THROW_WITH_ERRNO :
exceptions.h
GMX_THROW_WRAPPER_TESTEXCEPTION :
testexceptions.h
gmx_tmpnam() :
futil.h
gmx_truncate() :
futil.h
gmx_unused :
basedefinitions.h
GMX_UNUSED_VALUE :
basedefinitions.h
gmx_version() :
baseversion.h
gmx_version_git_central_base_hash() :
baseversion.h
gmx_version_git_full_hash() :
baseversion.h
gmx_warning() :
fatalerror.h
gmx_wcmatch() :
cstringutil.h
gmxlibfn() :
futil.h
GPU :
pme.h
gpu_set_host_malloc_and_free() :
gpu_utils.h
GpuApiCallBehavior :
gpu_utils.h
GpuFramework :
gpuregiontimer.h
GpuRegionTimer :
gpuregiontimer_ocl.h
gpuStreamSynchronize() :
oclutils.h
GpuTaskCompletion :
gpu_utils.h
Generated on Thu Jan 11 2018 02:32:35 for Gromacs by
1.8.5