Here is a list of all documented file members with links to the documentation:

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• IMD_apply_forces() : imd.cpp , imd.h
• imd_blockconnect() : imd.cpp
• imd_check_integrator_parallel() : imd.cpp
• imd_copyto_MD_Forces() : imd.cpp
• imd_create() : imd.cpp
• IMD_DISCONNECT : imd.cpp
• imd_disconnect() : imd.cpp
• IMD_ENERGIES : imd.cpp
• imd_fatal() : imd.cpp
• IMD_FCOORDS : imd.cpp
• IMD_fill_energy_record() : imd.cpp , imd.h
• IMD_finalize() : imd.cpp , imd.h
• IMD_get_step() : imd.cpp , imd.h
• IMD_GO : imd.cpp
• IMD_HANDSHAKE : imd.cpp
• imd_handshake() : imd.cpp
• IMD_IOERROR : imd.cpp
• IMD_KILL : imd.cpp
• IMD_MDCOMM : imd.cpp
• IMD_NR : imd.cpp
• IMD_PAUSE : imd.cpp
• IMD_prep_energies_send_positions() : imd.cpp , imd.h
• imd_prepare_master_socket() : imd.cpp
• imd_prepare_MD_Forces() : imd.cpp
• imd_prepare_vmd_Forces() : imd.cpp
• imd_read_multiple() : imd.cpp
• imd_read_vmd_Forces() : imd.cpp
• imd_readcommand() : imd.cpp
• imd_recv_header() : imd.cpp
• imd_recv_mdcomm() : imd.cpp
• imd_remove_molshifts() : imd.cpp
• imd_send_energies() : imd.cpp
• IMD_send_positions() : imd.cpp , imd.h
• imd_send_rvecs() : imd.cpp
• imd_sock_listen() : imdsocket.cpp , imdsocket.h
• imd_sync_nodes() : imd.cpp
• IMD_TRATE : imd.cpp
• imd_tryconnect() : imd.cpp
• imd_write_multiple() : imd.cpp
• IMDCONNECTWAIT : imd.cpp
• IMDLOOPWAIT : imd.cpp
• IMDMessageType : imd.cpp
• imdsock_accept() : imdsocket.cpp , imdsocket.h
• imdsock_bind() : imdsocket.cpp , imdsocket.h
• imdsock_create() : imdsocket.cpp , imdsocket.h
• imdsock_destroy() : imdsocket.cpp , imdsocket.h
• imdsock_getport() : imdsocket.cpp , imdsocket.h
• imdsock_read() : imdsocket.cpp , imdsocket.h
• imdsock_shutdown() : imdsocket.cpp , imdsocket.h
• imdsock_tryread() : imdsocket.cpp , imdsocket.h
• imdsock_write() : imdsocket.cpp , imdsocket.h
• IMDstr : imd.h
• IMDType_t : imd.cpp
• IMDVERSION : imd.cpp
• increaseNstlist() : nbnxn_tuning.cpp , nbnxn_tuning.h
• INDENT : txtdump.h
• INDEX_ALL : indexutil.h
• INDEX_ATOM : indexutil.h
• INDEX_MOL : indexutil.h
• INDEX_RES : indexutil.h
• index_type_for_poscalc() : poscalc.cpp
• INDEX_UNKNOWN : indexutil.h
• inhomogeneous_z() : domdec_setup.cpp
• init_atomcomm() : pme.cpp
• init_atomdata_first() : nbnxn_ocl_data_mgmt.cpp
• init_bonded_threading() : manage-threading.cpp , manage-threading.h
• init_cog() : sm_position.cpp
• init_com() : sm_position.cpp
• init_common() : sm_distance.cpp
• init_compare() : sm_compare.cpp
• init_comparison_value() : sm_compare.cpp
• init_data_common() : sm_distance.cpp
• init_data_compare() : sm_compare.cpp
• init_data_insolidangle() : sm_insolidangle.cpp
• init_data_kwint() : sm_keywords.cpp
• init_data_kwreal() : sm_keywords.cpp
• init_data_kwstr() : sm_keywords.cpp
• init_data_merge() : sm_merge.cpp
• init_data_permute() : sm_permute.cpp
• init_data_pos() : sm_position.cpp
• init_data_same() : sm_same.cpp
• init_dfhist_state() : state.h
• init_disres() : disre.h
• init_domain_decomposition() : domdec.h
• init_domdec_constraints() : domdec_constraints.cpp , domdec_constraints.h
• init_domdec_vsites() : domdec_vsite.cpp , domdec_vsite.h
• init_edsam() : edsam.h
• init_em() : minimize.cpp
• init_evaluator_group() : sm_keywords.cpp
• init_evaluator_pos() : sm_keywords.cpp
• init_ewald_coulomb_force_table() : nbnxn_ocl_data_mgmt.cpp
• init_ewald_tab() : ewald.cpp , ewald.h
• init_frame_common() : sm_distance.cpp
• init_frame_eval() : evaluate.cpp
• init_frame_insolidangle() : sm_insolidangle.cpp
• init_frame_kweval() : sm_keywords.cpp
• init_frame_same_int() : sm_same.cpp
• init_frame_same_str() : sm_same.cpp
• init_gpu() : gpu_utils.h , gpu_utils_ocl.cpp
• init_gtc_state() : state.h
• init_IMD() : imd.cpp , imd.h
• init_imd_prepare_for_x_assembly() : imd.cpp
• init_imd_prepare_mols_in_imdgroup() : imd.cpp
• init_insolidangle() : sm_insolidangle.cpp
• init_item_comg() : compiler.cpp
• init_item_compilerdata() : compiler.cpp
• init_item_evalfunc() : compiler.cpp
• init_item_evaloutput() : compiler.cpp
• init_item_minmax_groups() : compiler.cpp
• init_item_staticeval() : compiler.cpp
• init_item_subexpr_flags() : compiler.cpp
• init_item_subexpr_refcount() : compiler.cpp
• init_keyword_internal() : parsetree.cpp
• init_kweval() : sm_keywords.cpp
• init_kwint() : sm_keywords.cpp
• init_kwpos() : sm_position.cpp
• init_kwreal() : sm_keywords.cpp
• init_kwstr() : sm_keywords.cpp
• init_merge() : sm_merge.cpp
• init_method() : compiler.cpp
• init_method_token() : scanner_internal.cpp
• init_nbparam() : nbnxn_ocl_data_mgmt.cpp
• init_orires() : orires.h
• init_output_common() : sm_merge.cpp
• init_output_kweval() : sm_keywords.cpp
• init_output_merge() : sm_merge.cpp
• init_output_permute() : sm_permute.cpp
• init_output_plus() : sm_merge.cpp
• init_output_pos() : sm_position.cpp
• init_overlap_comm() : pme.cpp
• init_parallel() : mdrun.h
• init_param_token() : scanner_internal.cpp
• init_permute() : sm_permute.cpp
• init_plist() : nbnxn_ocl_data_mgmt.cpp
• init_pos_keyword_defaults() : compiler.cpp
• init_pull() : pull.h
• init_required_atoms() : compiler.cpp
• init_root_item() : compiler.cpp
• init_rot() : pull_rotation.h
• init_same() : sm_same.cpp
• init_swapcoords() : swapcoords.h , swapcoords.cpp
• init_swapstate() : swapcoords.cpp
• init_timers() : nbnxn_ocl_data_mgmt.cpp
• init_timings() : nbnxn_ocl_data_mgmt.cpp
• initialize_evalgrps() : compiler.cpp
• initiate_fit_params() : expfit.cpp
• initUmbrellaWindows() : gmx_wham.cpp
• int2YN : gmx_wham.cpp
• INT_VALUE : selvalue.h
• interleave : domdec.h
• INTMODIFIER : md_enums.h
• is_at_residue_boundary() : indexutil.cpp
• is_gmx_supported_gpu_id() : gpu_utils_ocl.cpp
• is_in_channel() : swapcoords.cpp
• is_multisim_option_set() : mdrun.cpp
• is_optional() : filenm.h
• is_output() : filenm.h
• is_set() : filenm.h
• is_surface_covered() : sm_insolidangle.cpp
• isHostMemoryPinned() : gpu_utils.h
• isSimdAligned() : simd.h