Gromacs
5.1.5
Main Page
Modules
Other Docs
Namespaces
Classes
Files
Examples
File List
File Members
All
Functions
Variables
Typedefs
Enumerations
Enumerator
Macros
_
a
b
c
d
e
f
g
h
i
l
m
n
o
p
r
s
t
u
w
All
Classes
Namespaces
Files
Functions
Variables
Typedefs
Enumerations
Enumerator
Friends
Macros
Groups
Pages
- g -
get_acffitfn() :
autocorr.h
get_acfnout() :
autocorr.h
get_center() :
groupcoord.h
get_center_comm() :
groupcoord.h
get_current_cuda_gpu_device_id() :
gpu_utils.h
get_gpu_device_id() :
gpu_utils.h
get_gpu_device_info_string() :
gpu_utils.h
get_ocl_gpu_device_name() :
gpu_utils.h
get_pme_ddnodes() :
domdec.h
get_pme_nnodes() :
domdec.h
get_pull_coord_value() :
pull.h
get_sum_of_positions() :
groupcoord.h
gmx_abort() :
basenetwork.h
gmx_ana_index_check_range() :
indexutil.h
gmx_ana_index_check_sorted() :
indexutil.h
gmx_ana_index_clear() :
indexutil.h
gmx_ana_index_contains() :
indexutil.h
gmx_ana_index_copy() :
indexutil.h
gmx_ana_index_deinit() :
indexutil.h
gmx_ana_index_difference() :
indexutil.h
gmx_ana_index_difference_size() :
indexutil.h
gmx_ana_index_dump() :
indexutil.h
gmx_ana_index_equals() :
indexutil.h
gmx_ana_index_get_max_index() :
indexutil.h
gmx_ana_index_has_complete_elems() :
indexutil.h
gmx_ana_index_has_full_ablocks() :
indexutil.h
gmx_ana_index_has_full_blocks() :
indexutil.h
gmx_ana_index_init_simple() :
indexutil.h
gmx_ana_index_intersection() :
indexutil.h
gmx_ana_index_make_block() :
indexutil.h
gmx_ana_index_merge() :
indexutil.h
gmx_ana_index_partition() :
indexutil.h
gmx_ana_index_reserve() :
indexutil.h
gmx_ana_index_set() :
indexutil.h
gmx_ana_index_sort() :
indexutil.h
gmx_ana_index_squeeze() :
indexutil.h
gmx_ana_index_union() :
indexutil.h
gmx_ana_indexgrps_extract() :
indexutil.h
gmx_ana_indexgrps_find() :
indexutil.h
gmx_ana_indexgrps_free() :
indexutil.h
gmx_ana_indexgrps_get_grp() :
indexutil.h
gmx_ana_indexgrps_init() :
indexutil.h
gmx_ana_indexgrps_is_empty() :
indexutil.h
gmx_ana_indexgrps_print() :
indexutil.h
gmx_ana_indexmap_clear() :
indexutil.h
gmx_ana_indexmap_copy() :
indexutil.h
gmx_ana_indexmap_deinit() :
indexutil.h
gmx_ana_indexmap_init() :
indexutil.h
gmx_ana_indexmap_init_orgid_group() :
indexutil.h
gmx_ana_indexmap_reserve() :
indexutil.h
gmx_ana_indexmap_set_static() :
indexutil.h
gmx_ana_indexmap_update() :
indexutil.h
gmx_ana_pos_add_to_group() :
position.h
gmx_ana_pos_append() :
position.h
gmx_ana_pos_append_finish() :
position.h
gmx_ana_pos_append_init() :
position.h
gmx_ana_pos_copy() :
position.h
gmx_ana_pos_empty() :
position.h
gmx_ana_pos_empty_init() :
position.h
gmx_ana_pos_init_const() :
position.h
gmx_ana_pos_reserve() :
position.h
gmx_ana_pos_reserve_for_append() :
position.h
gmx_ana_pos_reserve_forces() :
position.h
gmx_ana_pos_reserve_velocities() :
position.h
gmx_ana_pos_set_nr() :
position.h
gmx_chdir() :
futil.h
gmx_ctime_r() :
sysinfo.h
gmx_cycles_calibrate() :
cyclecounter.h
gmx_cycles_have_counter() :
cyclecounter.h
gmx_cycles_read() :
cyclecounter.h
gmx_disable_file_buffering() :
futil.h
gmx_fatal() :
fatalerror.h
gmx_fatal_mpi_va() :
fatalerror.h
gmx_fatal_set_log_file() :
fatalerror.h
gmx_fexist() :
futil.h
gmx_ffclose() :
futil.h
gmx_ffopen() :
futil.h
gmx_fft_1d() :
fft.h
gmx_fft_1d_real() :
fft.h
gmx_fft_2d_real() :
fft.h
gmx_fft_cleanup() :
fft.h
gmx_fft_destroy() :
fft.h
gmx_fft_get_version_info() :
fft.h
gmx_fft_init_1d() :
fft.h
gmx_fft_init_1d_real() :
fft.h
gmx_fft_init_2d_real() :
fft.h
gmx_fft_init_many_1d() :
fft.h
gmx_fft_init_many_1d_real() :
fft.h
gmx_fft_many_1d() :
fft.h
gmx_fft_many_1d_real() :
fft.h
gmx_fft_transpose_2d() :
fft.h
gmx_file_copy() :
futil.h
gmx_file_rename() :
futil.h
gmx_format_current_time() :
sysinfo.h
gmx_fseek() :
futil.h
gmx_fsync() :
futil.h
gmx_ftell() :
futil.h
gmx_getcwd() :
futil.h
gmx_gethostname() :
sysinfo.h
gmx_getpid() :
sysinfo.h
gmx_getuid() :
sysinfo.h
gmx_getusername() :
sysinfo.h
gmx_hostname_num() :
basenetwork.h
gmx_init_debug() :
fatalerror.h
gmx_many_fft_destroy() :
fft.h
gmx_mpi_initialized() :
basenetwork.h
gmx_node_num() :
basenetwork.h
gmx_node_rank() :
basenetwork.h
gmx_omp_check_thread_affinity() :
gmxomp.h
gmx_omp_get_max_threads() :
gmxomp.h
gmx_omp_get_num_procs() :
gmxomp.h
gmx_omp_get_thread_num() :
gmxomp.h
gmx_omp_set_num_threads() :
gmxomp.h
gmx_pause() :
gmxomp.h
gmx_physicalnode_id_hash() :
basenetwork.h
gmx_pme_calc_energy() :
pme.h
gmx_pme_destroy() :
pme.h
gmx_pme_do() :
pme.h
gmx_pme_init() :
pme.h
gmx_pme_receive_f() :
pme.h
gmx_pme_send_coordinates() :
pme.h
gmx_pme_send_finish() :
pme.h
gmx_pme_send_parameters() :
pme.h
gmx_pme_send_resetcounters() :
pme.h
gmx_pmeonly() :
pme.h
gmx_qsort() :
qsort_threadsafe.h
gmx_run_cmain() :
cmdlineinit.h
gmx_set_max_backup_count() :
futil.h
gmx_set_nice() :
sysinfo.h
gmx_simd4_align_d() :
simd.h
gmx_simd4_align_f() :
simd.h
gmx_simd4_dotproduct3_d() :
impl_reference.h
gmx_simd4_dotproduct3_f() :
impl_reference.h
gmx_simd4_invsqrt_d() :
simd_math.h
gmx_simd4_invsqrt_f() :
simd_math.h
gmx_simd4_invsqrt_singleaccuracy_d() :
simd_math.h
gmx_simd4_norm2_d() :
vector_operations.h
gmx_simd4_norm2_f() :
vector_operations.h
gmx_simd4_rsqrt_iter_d() :
simd_math.h
gmx_simd4_rsqrt_iter_f() :
simd_math.h
gmx_simd4_sum4_d() :
simd_math.h
gmx_simd4_sum4_f() :
simd_math.h
gmx_simd_acos_d() :
simd_math.h
gmx_simd_acos_f() :
simd_math.h
gmx_simd_acos_singleaccuracy_d() :
simd_math.h
gmx_simd_add_d() :
impl_reference.h
gmx_simd_add_di() :
impl_reference.h
gmx_simd_add_f() :
impl_reference.h
gmx_simd_add_fi() :
impl_reference.h
gmx_simd_align_d() :
simd.h
gmx_simd_align_di() :
simd.h
gmx_simd_align_f() :
simd.h
gmx_simd_align_fi() :
simd.h
gmx_simd_and_d() :
impl_reference.h
gmx_simd_and_db() :
impl_reference.h
gmx_simd_and_di() :
impl_reference.h
gmx_simd_and_dib() :
impl_reference.h
gmx_simd_and_f() :
impl_reference.h
gmx_simd_and_fb() :
impl_reference.h
gmx_simd_and_fi() :
impl_reference.h
gmx_simd_and_fib() :
impl_reference.h
gmx_simd_andnot_d() :
impl_reference.h
gmx_simd_andnot_di() :
impl_reference.h
gmx_simd_andnot_f() :
impl_reference.h
gmx_simd_andnot_fi() :
impl_reference.h
gmx_simd_anytrue_db() :
impl_reference.h
gmx_simd_anytrue_dib() :
impl_reference.h
gmx_simd_anytrue_fb() :
impl_reference.h
gmx_simd_anytrue_fib() :
impl_reference.h
gmx_simd_asin_d() :
simd_math.h
gmx_simd_asin_f() :
simd_math.h
gmx_simd_asin_singleaccuracy_d() :
simd_math.h
gmx_simd_atan2_d() :
simd_math.h
gmx_simd_atan2_f() :
simd_math.h
gmx_simd_atan2_singleaccuracy_d() :
simd_math.h
gmx_simd_atan_d() :
simd_math.h
gmx_simd_atan_f() :
simd_math.h
gmx_simd_atan_singleaccuracy_d() :
simd_math.h
gmx_simd_blendnotzero_d() :
impl_reference.h
gmx_simd_blendnotzero_di() :
impl_reference.h
gmx_simd_blendnotzero_f() :
impl_reference.h
gmx_simd_blendnotzero_fi() :
impl_reference.h
gmx_simd_blendv_d() :
impl_reference.h
gmx_simd_blendv_di() :
impl_reference.h
gmx_simd_blendv_f() :
impl_reference.h
gmx_simd_blendv_fi() :
impl_reference.h
gmx_simd_blendzero_d() :
impl_reference.h
gmx_simd_blendzero_di() :
impl_reference.h
gmx_simd_blendzero_f() :
impl_reference.h
gmx_simd_blendzero_fi() :
impl_reference.h
gmx_simd_cmpeq_d() :
impl_reference.h
gmx_simd_cmpeq_di() :
impl_reference.h
gmx_simd_cmpeq_f() :
impl_reference.h
gmx_simd_cmpeq_fi() :
impl_reference.h
gmx_simd_cmple_d() :
impl_reference.h
gmx_simd_cmple_f() :
impl_reference.h
gmx_simd_cmplt_d() :
impl_reference.h
gmx_simd_cmplt_di() :
impl_reference.h
gmx_simd_cmplt_f() :
impl_reference.h
gmx_simd_cmplt_fi() :
impl_reference.h
gmx_simd_cos_d() :
simd_math.h
gmx_simd_cos_f() :
simd_math.h
gmx_simd_cos_singleaccuracy_d() :
simd_math.h
gmx_simd_cprod_d() :
vector_operations.h
gmx_simd_cprod_f() :
vector_operations.h
gmx_simd_cvt_d2f() :
impl_reference.h
gmx_simd_cvt_d2i() :
impl_reference.h
gmx_simd_cvt_db2dib() :
impl_reference.h
gmx_simd_cvt_dd2f() :
impl_reference.h
gmx_simd_cvt_dib2db() :
impl_reference.h
gmx_simd_cvt_f2d() :
impl_reference.h
gmx_simd_cvt_f2dd() :
impl_reference.h
gmx_simd_cvt_f2i() :
impl_reference.h
gmx_simd_cvt_fb2fib() :
impl_reference.h
gmx_simd_cvt_fib2fb() :
impl_reference.h
gmx_simd_cvt_i2d() :
impl_reference.h
gmx_simd_cvt_i2f() :
impl_reference.h
gmx_simd_cvtt_d2i() :
impl_reference.h
gmx_simd_cvtt_f2i() :
impl_reference.h
gmx_simd_erf_d() :
simd_math.h
gmx_simd_erf_f() :
simd_math.h
gmx_simd_erf_singleaccuracy_d() :
simd_math.h
gmx_simd_erfc_d() :
simd_math.h
gmx_simd_erfc_f() :
simd_math.h
gmx_simd_erfc_singleaccuracy_d() :
simd_math.h
gmx_simd_exp2_d() :
simd_math.h
gmx_simd_exp2_f() :
simd_math.h
gmx_simd_exp2_singleaccuracy_d() :
simd_math.h
gmx_simd_exp_d() :
simd_math.h
gmx_simd_exp_f() :
simd_math.h
gmx_simd_exp_singleaccuracy_d() :
simd_math.h
gmx_simd_extract_di() :
impl_reference.h
gmx_simd_extract_fi() :
impl_reference.h
gmx_simd_fabs_d() :
impl_reference.h
gmx_simd_fabs_f() :
impl_reference.h
gmx_simd_fneg_d() :
impl_reference.h
gmx_simd_fneg_f() :
impl_reference.h
gmx_simd_fraction_d() :
impl_reference.h
gmx_simd_fraction_f() :
impl_reference.h
gmx_simd_get_exponent_d() :
impl_reference.h
gmx_simd_get_exponent_f() :
impl_reference.h
gmx_simd_get_mantissa_d() :
impl_reference.h
gmx_simd_get_mantissa_f() :
impl_reference.h
gmx_simd_inv_d() :
simd_math.h
gmx_simd_inv_f() :
simd_math.h
gmx_simd_inv_maskfpe_d() :
simd_math.h
gmx_simd_inv_maskfpe_f() :
simd_math.h
gmx_simd_inv_maskfpe_singleaccuracy_d() :
simd_math.h
gmx_simd_inv_notmaskfpe_d() :
simd_math.h
gmx_simd_inv_notmaskfpe_f() :
simd_math.h
gmx_simd_inv_notmaskfpe_singleaccuracy_d() :
simd_math.h
gmx_simd_inv_singleaccuracy_d() :
simd_math.h
gmx_simd_invsqrt_d() :
simd_math.h
gmx_simd_invsqrt_f() :
simd_math.h
gmx_simd_invsqrt_maskfpe_d() :
simd_math.h
gmx_simd_invsqrt_maskfpe_f() :
simd_math.h
gmx_simd_invsqrt_maskfpe_singleaccuracy_d() :
simd_math.h
gmx_simd_invsqrt_notmaskfpe_d() :
simd_math.h
gmx_simd_invsqrt_notmaskfpe_f() :
simd_math.h
gmx_simd_invsqrt_notmaskfpe_singleaccuracy_d() :
simd_math.h
gmx_simd_invsqrt_pair_d() :
simd_math.h
gmx_simd_invsqrt_pair_f() :
simd_math.h
gmx_simd_invsqrt_pair_singleaccuracy_d() :
simd_math.h
gmx_simd_invsqrt_singleaccuracy_d() :
simd_math.h
gmx_simd_iprod_d() :
vector_operations.h
gmx_simd_iprod_f() :
vector_operations.h
gmx_simd_load1_d() :
impl_reference.h
gmx_simd_load1_f() :
impl_reference.h
gmx_simd_load_d() :
impl_reference.h
gmx_simd_load_di() :
impl_reference.h
gmx_simd_load_f() :
impl_reference.h
gmx_simd_load_fi() :
impl_reference.h
gmx_simd_log_d() :
simd_math.h
gmx_simd_log_f() :
simd_math.h
gmx_simd_log_singleaccuracy_d() :
simd_math.h
gmx_simd_max_d() :
impl_reference.h
gmx_simd_max_f() :
impl_reference.h
gmx_simd_min_d() :
impl_reference.h
gmx_simd_min_f() :
impl_reference.h
gmx_simd_mul_d() :
impl_reference.h
gmx_simd_mul_di() :
impl_reference.h
gmx_simd_mul_f() :
impl_reference.h
gmx_simd_mul_fi() :
impl_reference.h
gmx_simd_norm2_d() :
vector_operations.h
gmx_simd_norm2_f() :
vector_operations.h
gmx_simd_or_d() :
impl_reference.h
gmx_simd_or_db() :
impl_reference.h
gmx_simd_or_di() :
impl_reference.h
gmx_simd_or_dib() :
impl_reference.h
gmx_simd_or_f() :
impl_reference.h
gmx_simd_or_fb() :
impl_reference.h
gmx_simd_or_fi() :
impl_reference.h
gmx_simd_or_fib() :
impl_reference.h
gmx_simd_pmecorrF_d() :
simd_math.h
gmx_simd_pmecorrF_f() :
simd_math.h
gmx_simd_pmecorrF_singleaccuracy_d() :
simd_math.h
gmx_simd_pmecorrV_d() :
simd_math.h
gmx_simd_pmecorrV_f() :
simd_math.h
gmx_simd_pmecorrV_singleaccuracy_d() :
simd_math.h
gmx_simd_rcp_d() :
impl_reference.h
gmx_simd_rcp_f() :
impl_reference.h
gmx_simd_rcp_iter_d() :
simd_math.h
gmx_simd_rcp_iter_f() :
simd_math.h
gmx_simd_reduce_d() :
impl_reference.h
gmx_simd_reduce_f() :
impl_reference.h
gmx_simd_round_d() :
impl_reference.h
gmx_simd_round_f() :
impl_reference.h
gmx_simd_rsqrt_d() :
impl_reference.h
gmx_simd_rsqrt_f() :
impl_reference.h
gmx_simd_rsqrt_iter_d() :
simd_math.h
gmx_simd_rsqrt_iter_f() :
simd_math.h
gmx_simd_set1_d() :
impl_reference.h
gmx_simd_set1_di() :
impl_reference.h
gmx_simd_set1_f() :
impl_reference.h
gmx_simd_set1_fi() :
impl_reference.h
gmx_simd_set_exponent_d() :
impl_reference.h
gmx_simd_set_exponent_f() :
impl_reference.h
gmx_simd_setzero_d() :
impl_reference.h
gmx_simd_setzero_di() :
impl_reference.h
gmx_simd_setzero_f() :
impl_reference.h
gmx_simd_setzero_fi() :
impl_reference.h
gmx_simd_sin_d() :
simd_math.h
gmx_simd_sin_f() :
simd_math.h
gmx_simd_sin_singleaccuracy_d() :
simd_math.h
gmx_simd_sincos_d() :
simd_math.h
gmx_simd_sincos_f() :
simd_math.h
gmx_simd_sincos_singleaccuracy_d() :
simd_math.h
gmx_simd_slli_di() :
impl_reference.h
gmx_simd_slli_fi() :
impl_reference.h
gmx_simd_sqrt_d() :
simd_math.h
gmx_simd_sqrt_f() :
simd_math.h
gmx_simd_sqrt_singleaccuracy_d() :
simd_math.h
gmx_simd_srli_di() :
impl_reference.h
gmx_simd_srli_fi() :
impl_reference.h
gmx_simd_store_d() :
impl_reference.h
gmx_simd_store_di() :
impl_reference.h
gmx_simd_store_f() :
impl_reference.h
gmx_simd_store_fi() :
impl_reference.h
gmx_simd_sub_d() :
impl_reference.h
gmx_simd_sub_di() :
impl_reference.h
gmx_simd_sub_f() :
impl_reference.h
gmx_simd_sub_fi() :
impl_reference.h
gmx_simd_sum4_d() :
simd_math.h
gmx_simd_sum4_f() :
simd_math.h
gmx_simd_tan_d() :
simd_math.h
gmx_simd_tan_f() :
simd_math.h
gmx_simd_tan_singleaccuracy_d() :
simd_math.h
gmx_simd_trunc_d() :
impl_reference.h
gmx_simd_trunc_f() :
impl_reference.h
gmx_simd_xor_d() :
impl_reference.h
gmx_simd_xor_di() :
impl_reference.h
gmx_simd_xor_f() :
impl_reference.h
gmx_simd_xor_fi() :
impl_reference.h
gmx_simd_xor_sign_d() :
simd_math.h
gmx_simd_xor_sign_f() :
simd_math.h
gmx_stats_add_point() :
statistics.h
gmx_stats_add_points() :
statistics.h
gmx_stats_done() :
statistics.h
gmx_stats_dump_xy() :
statistics.h
gmx_stats_get_a() :
statistics.h
gmx_stats_get_ab() :
statistics.h
gmx_stats_get_ase() :
statistics.h
gmx_stats_get_average() :
statistics.h
gmx_stats_get_corr_coeff() :
statistics.h
gmx_stats_get_error() :
statistics.h
gmx_stats_get_npoints() :
statistics.h
gmx_stats_get_point() :
statistics.h
gmx_stats_get_rmsd() :
statistics.h
gmx_stats_get_sigma() :
statistics.h
gmx_stats_init() :
statistics.h
gmx_stats_make_histogram() :
statistics.h
gmx_stats_message() :
statistics.h
gmx_stats_remove_outliers() :
statistics.h
gmx_step_str() :
cstringutil.h
gmx_strcasecmp() :
cstringutil.h
gmx_strcasecmp_min() :
cstringutil.h
gmx_strdup() :
cstringutil.h
gmx_strerror() :
fatalerror.h
gmx_string_fullhash_func() :
cstringutil.h
gmx_string_hash_func() :
cstringutil.h
gmx_strncasecmp() :
cstringutil.h
gmx_strncasecmp_min() :
cstringutil.h
gmx_strndup() :
cstringutil.h
gmx_tmpnam() :
futil.h
gmx_truncate() :
futil.h
gmx_version() :
baseversion.h
gmx_version_git_central_base_hash() :
baseversion.h
gmx_version_git_full_hash() :
baseversion.h
gmx_warning() :
fatalerror.h
gmx_wcmatch() :
cstringutil.h
gmxlibfn() :
futil.h
gpu_set_host_malloc_and_free() :
gpu_utils.h
Generated on Thu Dec 21 2017 11:46:19 for Gromacs by
1.8.5