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  A  
DevelopmentFeatureFlags (gmx)   IMdpOptionProvider (gmx)   NumPmeDomains   SimdDInt32Tag (gmx)   
HardwareTopology::Device (gmx)   InconsistentInputError (gmx)   
  O  
SimdDouble (gmx)   
AbstractAnalysisArrayData (gmx)   DeviceInformation   InstallationPrefixInfo (gmx)   SimdDoubleTag (gmx)   
AbstractAnalysisData (gmx)   DeviceStream   Int64Option (gmx)   ObservablesHistory   SimdFBool (gmx)   
AbstractAverageHistogram (gmx)   DeviceStreamManager (gmx)   Int64OptionInfo (gmx)   OpenClTraits (gmx)   SimdFIBool (gmx)   
AbstractCompositeHelpTopic (gmx)   df_history_t   IntegerOption (gmx)   OpenClTraits< cl_command_queue > (gmx)   SimdFInt32 (gmx)   
AbstractOption (gmx)   Grid::Dimensions (Nbnxm)   IntegerOptionInfo (gmx)   OpenClTraits< cl_context > (gmx)   SimdFInt32Tag (gmx)   
AbstractOptionSection (gmx)   DirectoryEnumerator (gmx)   InteractionListHandle   OpenClTraits< cl_kernel > (gmx)   SimdFloat (gmx)   
AbstractOptionSectionHandle (gmx)   DomainDecompositionBuilder (gmx)   InteractionOfType   OpenClTraits< cl_program > (gmx)   SimdFloatTag (gmx)   
AbstractOptionStorage (gmx)   DomainLifetimeWorkload (gmx)   InteractionsOfType   OpenClTraitsBase (gmx)   SimdSetZeroProxy (gmx)   
AbstractPlotModule (gmx)   DomdecOptions (gmx)   InteractiveMD (gmx)   OptionInfo (gmx)   SimdTraits (gmx::internal)   
AbstractSimpleHelpTopic (gmx)   DoubleOption (gmx)   InteractiveTestHelper (gmx::test)   OptionManagerContainer (gmx)   SimpleHelpTopic (gmx)   
accessor_basic (gmx)   DoubleOptionInfo (gmx)   InternalError (gmx)   Options (gmx)   SimulationAlgorithmSetupError (gmx)   
AffineTransformation (gmx)   
  E  
InvalidInputError (gmx)   OptionsAssigner (gmx)   SimulationContext (gmx)   
KeyValueTreeTransformRuleBuilder::AfterFrom (gmx)   IonSwapping (gmx)   OptionsBehaviorCollection (gmx)   SimulationGroups   
AlignedAllocationPolicy (gmx)   ekinstate_t   IOptionManager (gmx)   OptionSection (gmx)   SimulationInputHandle   
AlignedArray< double, N > (gmx)   ElementNotFoundError (gmx)   IOptionsBehavior (gmx)   OptionSectionHandle (gmx)   SimulationInstabilityError (gmx)   
AlignedArray< float, N > (gmx)   EnergyCalculationFrequencyErrors (gmx)   IOptionsContainer (gmx)   OptionsIterator (gmx)   SimulationSignal (gmx)   
Allocator (gmx)   gmx_ga2la_t::Entry   IOptionsContainerWithSections (gmx)   OptionsModifyingIterator (gmx)   SimulationSignaller (gmx)   
AllocatorTest (gmx::test)   EnumerationArray (gmx)   IOutputAdapter (gmx)   OptionsModifyingTypeVisitor (gmx)   SimulationTimeStep (gmx)   
AnalysisArrayData (gmx)   EnumerationIterator (gmx)   IProgramContext (gmx)   OptionsModifyingVisitor (gmx)   SimulationWorkload (gmx)   
AnalysisData (gmx)   EnumerationWrapper (gmx)   IRestraintPotential (gmx)   OptionStorageTemplate (gmx)   SimulatorBuilder (gmx)   
AnalysisDataAverageModule (gmx)   EnumOption (gmx)   ISerializer (gmx)   OptionStorageTemplateSimple (gmx)   SimulatorConfig (gmx)   
AnalysisDataBinAverageModule (gmx)   EnumOptionInfo (gmx)   isIntegralConstant (gmx)   OptionsTypeVisitor (gmx)   SimulatorEnv (gmx)   
AnalysisDataDisplacementModule (gmx)   EwaldBoxZScaler   IsSerializableEnum (gmx)   OptionsVisitor (gmx)   SimulatorStateData (gmx)   
AnalysisDataFrameAverageModule (gmx)   ExactTextMatch (gmx::test)   Range::iterator (gmx)   OptionTemplate (gmx)   Site (gmx)   
AnalysisDataFrameHeader (gmx)   ExceptionInfo (gmx)   ITextBlockMatcher (gmx::test)   OptionValueConverterSimple (gmx)   HardwareTopology::Socket (gmx)   
AnalysisDataFrameRef (gmx)   ExceptionInitializer (gmx)   ITextBlockMatcherSettings (gmx::test)   OutputAdapterContainer (gmx)   StandardInputStream (gmx)   
AnalysisDataHandle (gmx)   ExclusionBlock (gmx)   ITopologyProvider (gmx)   OutputRequirementOptionDirector (gmx)   StaticLog2 (gmx)   
AnalysisDataLifetimeModule (gmx)   ExponentialDistribution (gmx)   
  K  
OutputRequirements (gmx)   StaticLog2< 0 > (gmx)   
AnalysisDataModuleManager (gmx)   ExponentialMovingAverage (gmx)   OutputSelector (gmx)   StaticLog2< 1 > (gmx)   
AnalysisDataModuleParallel (gmx)   ExponentialMovingAverageState (gmx)   KeyValueTreeBuilder (gmx)   OutputSelectorDeathTest (gmx::test)   StdioTestHelper (gmx::test)   
AnalysisDataModuleSerial (gmx)   extents (gmx)   KeyValueTreeObjectArrayBuilder (gmx)   
  P  
StepWorkload (gmx)   
AnalysisDataParallelOptions (gmx)   extents_analyse< 0 > (gmx::detail)   KeyValueTreeObjectBuilder (gmx)   StopConditionSignal (gmx)   
AnalysisDataPlotModule (gmx)   extents_analyse< R, dynamic_extent, StaticExtents...> (gmx::detail)   KeyValueTreePath (gmx)   PaddedVector (gmx)   StopConditionTime (gmx)   
AnalysisDataPlotSettings (gmx)   extents_analyse< R, E0, StaticExtents...> (gmx::detail)   KeyValueTreeTransformRuleBuilder (gmx)   PaddingTraits (gmx::detail)   StopHandler (gmx)   
AnalysisDataPointSetRef (gmx)   
  F  
KeyValueTreeTransformRulesScoped (gmx)   PageAlignedAllocationPolicy (gmx)   StopHandlerBuilder (gmx)   
AnalysisDataSimpleHistogramModule (gmx)   KeyValueTreeUniformArrayBuilder (gmx)   PairlistSets   StringCompare (gmx)   
AnalysisDataStorage (gmx)   FileIOError (gmx)   KeyValueTreeValueBuilder (gmx)   PairSearch   StringFormatter (gmx)   
AnalysisDataStorageFrame (gmx)   FileNameOption (gmx)   
  L  
PairsearchWork   StringInputStream (gmx)   
AnalysisDataTestFixture (gmx::test)   FileNameOptionInfo (gmx)   ParallelConsistencyError (gmx)   StringOption (gmx)   
AnalysisDataTestInput (gmx::test)   FileNameOptionManager (gmx)   layout_right (gmx)   UniformRealDistribution::param_type (gmx)   StringOptionInfo (gmx)   
AnalysisDataTestInputFrame (gmx::test)   FilteringExactTextMatch (gmx::test)   LegacyEnumOption (gmx)   UniformIntDistribution::param_type (gmx)   StringOutputStream (gmx)   
AnalysisDataTestInputPointSet (gmx::test)   FixedCapacityVector (gmx)   LegacyInput (gmx)   TabulatedNormalDistribution::param_type (gmx)   StringTable   
AnalysisDataValue (gmx)   FlagsTemplate (gmx)   LegacyMdrunOptions (gmx)   NormalDistribution::param_type (gmx)   StringTableBuilder   
AnalysisDataVectorPlotModule (gmx)   FlagTest (gmx::test)   ListedForces   GammaDistribution::param_type (gmx)   StringTableEntry   
AnalysisDataWeightedHistogramModule (gmx)   FloatingPointDifference (gmx::test)   ListOfLists (gmx)   ExponentialDistribution::param_type (gmx)   StringTestBase (gmx::test)   
AnalysisHistogramSettings (gmx)   FloatingPointTolerance (gmx::test)   LocalAtomSet (gmx)   PartialDeserializedTprFile   
  T  
AnalysisHistogramSettingsInitializer (gmx)   FloatOption (gmx)   LocalAtomSetManager (gmx)   PbcAiuc   
AnalysisNeighborhood (gmx)   FloatOptionInfo (gmx)   LogEntryWriter (gmx)   PhysicalNodeCommunicator (gmx)   t_filenm   
AnalysisNeighborhoodPair (gmx)   ForceBuffers (gmx)   LoggerBuilder (gmx)   PmeForceSenderGpu (gmx)   t_mapping   
AnalysisNeighborhoodPairSearch (gmx)   ForceBuffersView (gmx)   LoggerOwner (gmx)   PmeGpuProgram   t_matrix   
AnalysisNeighborhoodPositions (gmx)   ForceHelperBuffers   LoggerTestHelper (gmx::test)   PmePpCommGpu (gmx)   t_mdatoms   
AnalysisNeighborhoodSearch (gmx)   ForceOutputs (gmx)   HardwareTopology::LogicalProcessor (gmx)   GaussianSpreadKernelParameters::PositionAndAmplitude (gmx)   t_pargs   
AnalyticalSplineTableInput (gmx)   ForceProviderInput (gmx)   CpuInfo::LogicalProcessor (gmx)   PotentialPointData (gmx)   t_pbc   
Any (gmx)   ForceProviderOutput (gmx)   LogLevelHelper (gmx)   PpRanks   t_state   
AnyOutputSupportedFiles (gmx::test)   ForceProviders (gmx)   
  M  
PreprocessingAtomTypes   t_symbuf   
APIError (gmx)   ForceWithShiftForces (gmx)   PreprocessingBondAtomType   t_xpmelmt   
ArrayRef (gmx)   ForceWithVirial (gmx)   HardwareTopology::Machine (gmx)   PreprocessResidue   TabulatedNormalDistribution (gmx)   
ArrayRefWithPadding (gmx)   ForeignLambdaTerms   MappedUnionFinder (gmx)   PrivateImplPointer (gmx)   TestException (gmx::test)   
AtomIterator   
  G  
layout_right::mapping (gmx)   Profiling (gmx)   TestFileInputRedirector (gmx::test)   
AtomProperties   MDAtoms (gmx)   
  Q  
TestFileManager (gmx::test)   
AtomProxy   GammaDistribution (gmx)   MDLogger (gmx)   TestFileOutputRedirector (gmx::test)   
AtomRange   GaussianSpreadKernelParameters (gmx)   MdModuleNotification (gmx)   QuadraticSplineTable (gmx)   TestOptionsProvider (gmx::test)   
Awh (gmx)   GaussTransform3D (gmx)   MDModules (gmx)   
  R  
TestReferenceChecker (gmx::test)   
  B  
GlobalCommandLineHelpContext (gmx)   MdModulesCheckpointReadingBroadcast (gmx)   TestReferenceData (gmx::test)   
gmx_ana_index_t   MdModulesCheckpointReadingDataOnMaster (gmx)   Range (gmx)   TextFileMatch (gmx::test)   
basic_mdspan (gmx)   gmx_ana_indexmap_t   MdModulesEnergyOutputToDensityFittingRequestChecker (gmx)   RangeError (gmx)   TextInputFile (gmx)   
BasicVector (gmx)   gmx_ana_pos_t   MdModulesNotifier (gmx)   RangePartitioning (gmx)   TextInputStream (gmx)   
BenchmarkSystem (gmx)   gmx_cache_protect_t   MdModulesWriteCheckpointData (gmx)   ReadCheckpointDataHolder (gmx)   TextLineWrapper (gmx)   
BinaryInformationSettings (gmx)   gmx_enerdata_t   Mdrunner (gmx)   registerMdModuleNotification< CurrentCallParameter, CallParameter...> (gmx)   TextLineWrapperSettings (gmx)   
BondedInteraction   gmx_ffparams_t   MdrunnerBuilder (gmx)   RepeatingOptionSection (gmx)   TextOutputFile (gmx)   
BondedInteractionList   gmx_ga2la_t   MembedHolder (gmx)   RepeatingOptionSectionHandle (gmx)   TextOutputStream (gmx)   
BooleanOption (gmx)   gmx_localtop_t   MessageStringCollector (gmx)   ReplicaExchangeParameters   TextReader (gmx)   
BooleanOptionInfo (gmx)   gmx_molblock_t   MessageStringContext (gmx)   ResetHandler (gmx)   TextTableFormatter (gmx)   
BoxDeformationHandle (gmx)   gmx_moltype_t   MissingElementConnectionError (gmx)   RestraintManager (gmx)   TextWriter (gmx)   
  C  
gmx_multisim_t   ModularSimulator (gmx)   RestraintMDModule (gmx)   ThreeFry2x64 (gmx)   
gmx_sparsematrix   ModularSimulatorError (gmx)   
  S  
ThreeFry2x64Fast (gmx)   
HardwareTopology::Cache (gmx)   GpuHaloExchange (gmx)   ModuleSelection (gmx::test)   ThreeFry2x64General (gmx)   
CheckpointData (gmx)   GpuRegionTimerImpl   ModuleTest (gmx::test)   Selection (gmx)   TimeUnitBehavior (gmx)   
CheckpointError (gmx)   GpuRegionTimerWrapper   MoleculeBlockIndices   SelectionCollection (gmx)   TimeUnitManager (gmx)   
CheckpointHandler (gmx)   GpuTaskAssignments (gmx)   MoleculeInformation   SelectionFileOption (gmx)   ToleranceError (gmx)   
CheckpointHeaderContents   GpuTaskAssignmentsBuilder (gmx)   MoleculePatch   SelectionFileOptionInfo (gmx)   KeyValueTreeTransformRuleBuilder::ToObject (gmx)   
ClfftInitializer (gmx)   GpuTaskMapping (gmx)   MoleculePatchDatabase   SelectionOption (gmx)   TopologyData (gmx)   
ClHandle (gmx)   GromacsException (gmx)   MrcDataStatistics (gmx)   SelectionOptionBehavior (gmx)   TopologyInformation (gmx)   
CommandLine (gmx::test)   
  H  
MrcDensityMapHeader (gmx)   SelectionOptionInfo (gmx)   KeyValueTreeTransformRuleBuilder::ToValue (gmx)   
CommandLineHelpContext (gmx)   MrcDensityMapOfFloatFromFileReader (gmx)   SelectionOptionManager (gmx)   TprAndFileManager (gmx::test)   
CommandLineHelpWriter (gmx)   HardwareTopology (gmx)   MrcDensityMapOfFloatReader (gmx)   SelectionPosition (gmx)   TpxFileHeader   
CommandLineModuleGroup (gmx)   HashedMap (gmx)   MrcDensityMapOfFloatWriter (gmx)   SelectionTopologyProperties (gmx)   TrajectoryAnalysisCommandLineRunner (gmx)   
CommandLineModuleManager (gmx)   HelpLinks (gmx)   MrcDensitySkewData (gmx)   SetAtoms (gmx)   TrajectoryAnalysisModule (gmx)   
CommandLineModuleSettings (gmx)   HelpManager (gmx)   MtsLevel (gmx)   SetAtomsSupportedFiles (gmx::test)   TrajectoryAnalysisModuleData (gmx)   
CommandLineParser (gmx)   HelpWriterContext (gmx)   MultiDimArray (gmx)   SetAtomsUnSupportedFiles (gmx::test)   TrajectoryAnalysisSettings (gmx)   
CommandLineProgramContext (gmx)   history_t   
  N  
SetBox (gmx)   TrajectoryFileOpener (gmx)   
CommandLineTestBase (gmx::test)   HostAllocationPolicy (gmx)   SetForces (gmx)   TrajectoryFrameWriter (gmx)   
CommandLineTestHelper (gmx::test)   HardwareTopology::HWThread (gmx)   nbnxn_cj4_t   SetForceSupportedFiles (gmx::test)   TranslateAndScale (gmx)   
CompositeHelpTopic (gmx)   
  I  
nbnxn_cj_t   SetForceUnSupportedFiles (gmx::test)   
  U  
ConfMatch (gmx::test)   nbnxn_cycle_t   SetPrecision (gmx)   
Constraints (gmx)   IAnalysisDataModule (gmx)   nbnxn_excl_t   SetPrecisionSupportedFiles (gmx::test)   UniformIntDistribution (gmx)   
ConstraintsParam (gmx)   NbnxnPairlistCpuWork::IClusterData   nbnxn_im_ei_t   SetPrecisionUnSupportedFiles (gmx::test)   UniformRealDistribution (gmx)   
ConvertTprInfo (gmx)   ICommandLineModule (gmx)   nbnxn_sci   SetStartTime (gmx)   UnionFinder (gmx)   
HardwareTopology::Core (gmx)   ICommandLineOptionsModule (gmx)   NbnxnPairlistCpu   SetTimeStep (gmx)   Update (gmx)   
CpuInfo (gmx)   ICommandLineOptionsModuleSettings (gmx)   NbnxnPairlistCpuWork   SettleData (gmx)   UpdateGroupsCog (gmx)   
CrystallographicLabels (gmx)   IdentityFormatter (gmx)   no_delete (gmx)   SetVelocities (gmx)   UserInputError (gmx)   
CubicSplineTable (gmx)   IExecutableEnvironment (gmx)   NoContentsMatch (gmx::test)   SetVelocitySupportedFiles (gmx::test)   
  V  
  D  
IFileInputRedirector (gmx)   nonbonded_verlet_t   SetVelocityUnSupportedFiles (gmx::test)   
IFileMatcher (gmx::test)   NonbondedBenchmarkInfo (gmx)   shakedata (gmx)   VirtualSitesHandler (gmx)   
DataFileFinder (gmx)   IFileMatcherSettings (gmx::test)   NoOptionalOutput (gmx::test)   GaussianSpreadKernelParameters::Shape (gmx)   
  W  
DataFileInfo (gmx)   IFileOutputRedirector (gmx)   NormalDistribution (gmx)   Simd4DBool (gmx)   
DataFileOptions (gmx)   IForceProvider (gmx)   not_null (gmx::compat)   Simd4Double (gmx)   WholeMoleculeTransform (gmx)   
DDBalanceRegionHandler   IHelpTopic (gmx)   NoTextMatch (gmx::test)   Simd4FBool (gmx)   WriteCheckpointDataHolder (gmx)   
DefaultInitializationAllocator (gmx)   IKeyValueTreeTransformRules (gmx)   NotImplementedError (gmx)   Simd4Float (gmx)   
  X  
DensityFittingForce (gmx)   ILogTarget (gmx)   HardwareTopology::Numa (gmx)   SimdDBool (gmx)   
DensityFittingModuleInfo (gmx)   IMDModule (gmx)   HardwareTopology::NumaNode (gmx)   SimdDIBool (gmx)   XvgMatch (gmx::test)   
DensitySimilarityMeasure (gmx)   IMDOutputProvider (gmx)   NumericalSplineTableInput (gmx)   SimdDInt32 (gmx)   
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