Here is a list of all documented namespace members with links to the namespaces they belong to:

- c -

• c_architecture : gmx
• c_avoidFloatingPointAtomics() : gmx
• c_biasMaxNumDim : gmx
• c_changeAtomsTypeNames : gmx
• c_changeSettingTypeNames : gmx
• c_clSizeLog2 : gmx
• c_clSizeSq : gmx
• c_colvarsModuleName : gmx
• c_connectWait : gmx
• c_dBoxZ : gmx
• c_densityFittingAmplitudeMethodNames : gmx
• c_densitySimilarityMeasureMethodNames : gmx
• c_ftypeVsiteEnd : gmx
• c_ftypeVsiteStart : gmx
• c_headerSize : gmx
• c_inputBoxes : gmx::test
• c_inputPmeOrders : gmx::test
• c_linewidth : gmx
• c_loopWait : gmx
• c_maxConnections : gmx
• c_nbnxnCpuDynamicListPruningMinLifetime : gmx
• c_nbnxnGpuDynamicListPruningMinLifetime : gmx
• c_nbnxnGpuRollingListPruningInterval : gmx
• c_nbnxnListSizeFactorCpu : gmx
• c_nbnxnListSizeFactorGPU : gmx
• c_nbnxnListSizeFactorIntelXeonPhi : gmx
• c_nbnxnListSizeFactorMargin : gmx
• c_nbnxnMinDistanceSquared : gmx
• c_nnpotModuleName : gmx
• c_numBoundingBoxBounds1D : gmx
• c_numElecTypes : gmx
• c_numLambdaStates : gmx::test
• c_numVdwTypes : gmx
• c_packX4 : gmx
• c_packX8 : gmx
• c_protocolVersion : gmx
• c_pruneKernelJPackedConcurrency : gmx
• c_qmmmCP2KModuleName : gmx
• c_qmmmQMMethodNames : gmx
• c_sciHistogramSize : gmx
• c_sciSortingThreadsPerBlock : gmx
• c_simdBestPairAlignmentDouble : gmx
• c_simdBestPairAlignmentFloat : gmx
• c_sortGridMaxSizeFactor : gmx
• c_sortGridRatio : gmx
• c_splineModuliSinglePrecisionUlps : gmx::test
• c_syclPruneKernelJPackedConcurrency : gmx
• c_threadsPerBlock : gmx::test , gmx
• c_waterPositions() : gmx::test
• c_xvgFormatNames : gmx
• calc_bounding_box() : gmx
• calc_dist_iter() : gmx
• calc_shmem_required_nonbonded() : gmx
• calc_shmem_required_prune() : gmx
• calcBoundingBoxHalves() : gmx
• calcBoundingBoxXPacked() : gmx
• calcPruneVerletBufferSize() : gmx
• calculateAcceptanceWeight() : gmx
• calculateLJEwaldC6Grid() : gmx
• canSkipNonbondedWork() : gmx
• canTreatPRScalingMatrixAsDiagonal() : gmx
• cartesian : gmx
• CaseAndDashInsensitive : gmx
• CaseInsensitive : gmx
• castOrNull() : gmx
• cbrt() : gmx
• CenteringType : gmx
• centerTypeNames() : gmx
• ChangeAtomsType : gmx
• ChangeFrameInfoType : gmx
• ChangeFrameTimeType : gmx
• changePinningPolicy() : gmx
• ChangeSettingType : gmx
• charArrayRefFromArray() : gmx::test
• Charge : gmx
• ChargesVector : gmx::test
• check_assign_connected() : gmx
• check_assign_triangle() : gmx
• check_cons() : gmx
• check_grid_jump() : gmx
• checkAwhParams() : gmx
• CheckBondedInteractionsCallback : gmx
• checkBoxAgainstReference() : gmx::test
• checkConfFile() : gmx::test
• checkDeviceError() : gmx
• checkEnergiesAgainstReferenceData() : gmx::test
• checkForcesAgainstReference() : gmx::test
• checkForUnknownOptionsInKeyValueTree() : gmx
• checkGpu() : gmx
• checkHardwareOversubscription() : gmx
• checkIfRandomDeviceIsFunctional() : gmx
• checkInputConsistencyInterval() : gmx
• checkKernelSetup() : gmx
• checkMpiCudaAwareSupport() : gmx
• checkMpiHipAwareSupport() : gmx
• checkMpiZEAwareSupport() : gmx
• checkMtsRequirements() : gmx
• CheckpointDataOperation : gmx
• CheckpointSignal : gmx
• checkpointVersion() : gmx
• checkPositionsAgainstReference() : gmx::test
• checkPotentialEnergyValidity() : gmx
• checkRealGrid() : gmx::test
• checkTestNameLength() : gmx::test
• checkUseModularSimulator() : gmx
• checkUserGpuIds() : gmx
• checkVelocitiesAgainstReference() : gmx::test
• checkXvgFile() : gmx::test
• chooseAndLaunchNbnxmKernel() : gmx
• chooseAndLaunchNbnxmKernelPruneOnly() : gmx
• chooseLJCombinationRule() : gmx
• chooseLJPmeCombinationRule() : gmx
• cjFromCi() : gmx
• ClContext : gmx
• clear_constraint_quantity_nonlocal() : gmx
• clear_fshift() : gmx
• clearBufferAll() : gmx
• clearBufferFlagged() : gmx
• clearTaskForceBufferUsedElements() : gmx
• closeLogFile() : gmx
• clusterBoundingBoxDistance2() : gmx
• ClusterDistanceKernelType : gmx
• CodePath : gmx::test
• combine_bounding_box_pairs() : gmx
• combineMtsForces() : gmx
• CommandLineModuleGroupDataPointer : gmx
• CommandLineModuleGroupList : gmx
• CommandLineModuleMap : gmx
• CommandLineModulePointer : gmx
• CommandLinePointer : gmx::test
• Compare : gmx::test
• compareBox() : gmx::test
• compareCoordinates() : gmx::test
• compareDifferentIndices() : gmx::test
• compareForces() : gmx::test
• compareFrames() : gmx::test
• compareKeyValueTrees() : gmx
• compareVelocities() : gmx::test
• compareViews() : gmx::test
• compareViewsIgnoreConst() : gmx::test
• ComparisonConditions : gmx::test
• complexFloat64 : gmx
• complexInt32 : gmx
• CompositeHelpTopicPointer : gmx
• computeDerivativeForTransformationPullCoord() : gmx
• computeExpectedNumGlobalBondedInteractions() : gmx
• computeFepPeriod() : gmx
• computeForceSwitchVariables() : gmx
• ComputeGlobalsAlgorithm : gmx
• computeMaxUpdateGroupRadius() : gmx
• computePotentialSwitchVariables() : gmx
• computeQMBoxVec() : gmx
• computeSpecialForces() : gmx
• computeTotalSize() : gmx
• COMShiftType : gmx
• concatenateBeforeExtension() : gmx
• constr_iatomptr() : gmx
• constr_r_max() : gmx
• constr_r_max_moltype() : gmx
• constr_recur() : gmx
• constrain_coordinates() : gmx
• constrain_lincs() : gmx
• constrain_shake() : gmx
• constrain_velocities() : gmx
• constraintAtomRange() : gmx
• constraintGroupRadius() : gmx
• ConstraintVariable : gmx
• construct_vsites() : gmx
• construct_vsites_thread() : gmx
• constructVirtualSites() : gmx
• constructVirtualSitesGlobal() : gmx
• contains() : gmx
• convertDoubleReferenceValue() : gmx::test
• convertFlag() : gmx
• convertIlistToNbnxnOrder() : gmx
• convertLJCombinationRule() : gmx
• convertRVecToFloat3OnDevice() : gmx::test
• convertRVecToFloat3OnDevice_kernel() : gmx::test
• convertRVecToFloat3OnHost() : gmx::test
• convertSigmaEpsilonToC6C12() : gmx
• convertToCheckpointSignal() : gmx
• convertToResetSignal() : gmx
• convertToStopSignal() : gmx
• Coordinate : gmx
• CoordinateFileFlags : gmx
• CoordinatesVector : gmx::test
• CoordValue : gmx
• copy_rvec_to_nbat_real() : gmx
• copyOf() : gmx
• copyRVecToNbatPackedReal() : gmx
• copysign() : gmx
• cos() : gmx
• cosSingleAccuracy() : gmx
• Coulomb : gmx::test
• CoulombKernelType : gmx
• Count : gmx , gmx::test , gmx , gmx::test , gmx , gmx::test , gmx , gmx::test , gmx
• count_triangle_constraints() : gmx
• countFlexibleConstraints() : gmx
• countInterUpdategroupVsites() : gmx
• countNonlinearVsites() : gmx
• countPruneKernelTime() : gmx
• countSamples() : gmx
• countTrailingZeroRows() : gmx
• countWords() : gmx
• CPU : gmx::test
• cpuIsAmdZen1() : gmx
• cpuIsNeoverseV2() : gmx
• cpuIsX86Nehalem() : gmx
• CpuPlainC_1x1 : gmx
• CpuPlainC_4x4 : gmx
• CpuSimd_2xMM : gmx
• CpuSimd_4xM : gmx
• crattle() : gmx
• create_unique_with_deleter() : gmx
• createElectricFieldModule() : gmx
• createGroup() : gmx
• createInteractiveMolecularDynamicsModule() : gmx
• createMatrix3x3FromLegacyMatrix() : gmx
• createMinimalTrajectoryFrameWriter() : gmx::test
• CreateMissing : gmx::test
• createSelectionHelpTopic() : gmx
• createSimulationWorkload() : gmx
• createSwapCoordinatesModule() : gmx
• createTrajectoryFrameWriter() : gmx
• cross() : gmx
• crossCorrelation : gmx
• csettle() : gmx
• cshake() : gmx
• cuda_set_cacheconfig() : gmx
• Cufft : gmx
• CuFFTMp : gmx
• currentLambdas() : gmx
• Cut : gmx
• CutCombGeom : gmx
• CutCombLB : gmx
• cvtB2IB() : gmx
• cvtD2F() : gmx
• cvtDD2F() : gmx
• cvtF2D() : gmx
• cvtF2DD() : gmx
• cvtI2R() : gmx
• cvtIB2B() : gmx
• cvtR2I() : gmx
• cvttR2I() : gmx