Gromacs  2021.2
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Class Index
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  A  
CheckpointError (gmx)   NbnxnPairlistCpuWork::IClusterData   Options (gmx)   SimulationInputHandle   
CheckpointHeaderContents   ICommandLineModule (gmx)   OptionSection (gmx)   SimulationInstabilityError (gmx)   
AbstractAnalysisArrayData (gmx)   CommandLineHelpWriter (gmx)   ICommandLineOptionsModule (gmx)   OptionSectionHandle (gmx)   SimulationSignal (gmx)   
AbstractAnalysisData (gmx)   CommandLineModuleSettings (gmx)   ICommandLineOptionsModuleSettings (gmx)   OptionTemplate (gmx)   SimulationSignaller (gmx)   
AbstractAverageHistogram (gmx)   CommandLineParser (gmx)   IdentityFormatter (gmx)   OutputRequirementOptionDirector (gmx)   SimulatorConfig (gmx)   
AbstractOption (gmx)   ConstraintsParam (gmx)   InconsistentInputError (gmx)   OutputRequirements (gmx)   SimulatorEnv (gmx)   
AbstractOptionSection (gmx)   ConvertTprInfo (gmx)   InstallationPrefixInfo (gmx)   OutputSelector (gmx)   SimulatorStateData (gmx)   
AbstractOptionSectionHandle (gmx)   
  D  
Int64Option (gmx)   
  P  
StaticLog2 (gmx)   
AbstractPlotModule (gmx)   Int64OptionInfo (gmx)   StaticLog2< 0 > (gmx)   
AnalysisArrayData (gmx)   DataFileFinder (gmx)   IntegerOption (gmx)   PaddedVector (gmx)   StaticLog2< 1 > (gmx)   
AnalysisData (gmx)   DataFileInfo (gmx)   IntegerOptionInfo (gmx)   PaddingTraits (gmx::detail)   StringFormatter (gmx)   
AnalysisDataAverageModule (gmx)   DataFileOptions (gmx)   InteractionListHandle   PairlistSets   StringOption (gmx)   
AnalysisDataBinAverageModule (gmx)   df_history_t   InteractiveMD (gmx)   PairSearch   StringOptionInfo (gmx)   
AnalysisDataDisplacementModule (gmx)   Grid::Dimensions (Nbnxm)   InternalError (gmx)   PairsearchWork   StringTable   
AnalysisDataFrameAverageModule (gmx)   DoubleOption (gmx)   InvalidInputError (gmx)   ParallelConsistencyError (gmx)   StringTableEntry   
AnalysisDataFrameHeader (gmx)   DoubleOptionInfo (gmx)   IonSwapping (gmx)   UniformRealDistribution::param_type (gmx)   
  T  
AnalysisDataFrameRef (gmx)   
  E  
IOptionManager (gmx)   UniformIntDistribution::param_type (gmx)   
AnalysisDataHandle (gmx)   IOptionsBehavior (gmx)   TabulatedNormalDistribution::param_type (gmx)   t_filenm   
AnalysisDataLifetimeModule (gmx)   ElementNotFoundError (gmx)   IOptionsContainer (gmx)   NormalDistribution::param_type (gmx)   t_mapping   
AnalysisDataModuleParallel (gmx)   EnumOption (gmx)   IOptionsContainerWithSections (gmx)   GammaDistribution::param_type (gmx)   t_matrix   
AnalysisDataModuleSerial (gmx)   EnumOptionInfo (gmx)   IOutputAdapter (gmx)   ExponentialDistribution::param_type (gmx)   t_mdatoms   
AnalysisDataPlotModule (gmx)   ExceptionInfo (gmx)   IProgramContext (gmx)   PartialDeserializedTprFile   t_pargs   
AnalysisDataPlotSettings (gmx)   ExceptionInitializer (gmx)   IRestraintPotential (gmx)   PbcAiuc   t_pbc   
AnalysisDataPointSetRef (gmx)   ExponentialDistribution (gmx)   IsSerializableEnum (gmx)   PotentialPointData (gmx)   t_state   
AnalysisDataSimpleHistogramModule (gmx)   
  F  
Range::iterator (gmx)   PrivateImplPointer (gmx)   t_xpmelmt   
AnalysisDataValue (gmx)   ITopologyProvider (gmx)   Profiling (gmx)   TabulatedNormalDistribution (gmx)   
AnalysisDataVectorPlotModule (gmx)   FileIOError (gmx)   
  L  
  R  
TextLineWrapper (gmx)   
AnalysisDataWeightedHistogramModule (gmx)   FileNameOption (gmx)   TextLineWrapperSettings (gmx)   
AnalysisHistogramSettings (gmx)   FileNameOptionInfo (gmx)   LegacyEnumOption (gmx)   Range (gmx)   ThreeFry2x64 (gmx)   
AnalysisHistogramSettingsInitializer (gmx)   FileNameOptionManager (gmx)   LegacyInput (gmx)   RangeError (gmx)   ThreeFry2x64Fast (gmx)   
AnalysisNeighborhood (gmx)   FixedCapacityVector (gmx)   ListOfLists (gmx)   RangePartitioning (gmx)   ThreeFry2x64General (gmx)   
AnalysisNeighborhoodPair (gmx)   FlagsTemplate (gmx)   
  M  
RepeatingOptionSection (gmx)   TimeUnitBehavior (gmx)   
AnalysisNeighborhoodPairSearch (gmx)   FloatOption (gmx)   RepeatingOptionSectionHandle (gmx)   TimeUnitManager (gmx)   
AnalysisNeighborhoodPositions (gmx)   FloatOptionInfo (gmx)   MembedHolder (gmx)   
  S  
ToleranceError (gmx)   
AnalysisNeighborhoodSearch (gmx)   ForceHelperBuffers   MissingElementConnectionError (gmx)   TopologyData (gmx)   
APIError (gmx)   ForeignLambdaTerms   ModularSimulatorError (gmx)   Selection (gmx)   TrajectoryAnalysisCommandLineRunner (gmx)   
ArrayRef (gmx)   
  G  
MoleculeBlockIndices   SelectionCollection (gmx)   TrajectoryAnalysisModule (gmx)   
ArrayRefWithPadding (gmx)   MtsLevel (gmx)   SelectionOption (gmx)   TrajectoryAnalysisModuleData (gmx)   
AtomIterator   GammaDistribution (gmx)   
  N  
SelectionOptionBehavior (gmx)   TrajectoryAnalysisSettings (gmx)   
AtomProperties   gmx_ana_index_t   SelectionOptionInfo (gmx)   TrajectoryFileOpener (gmx)   
AtomProxy   gmx_ana_indexmap_t   nbnxn_cj4_t   SelectionOptionManager (gmx)   TrajectoryFrameWriter (gmx)   
AtomRange   gmx_ana_pos_t   nbnxn_cj_t   SelectionPosition (gmx)   
  U  
  B  
gmx_cache_protect_t   nbnxn_cycle_t   SelectionTopologyProperties (gmx)   
gmx_enerdata_t   nbnxn_excl_t   SetAtoms (gmx)   UniformIntDistribution (gmx)   
BasicVector (gmx)   gmx_ffparams_t   nbnxn_im_ei_t   SetBox (gmx)   UniformRealDistribution (gmx)   
BenchmarkSystem (gmx)   gmx_localtop_t   nbnxn_sci   SetForces (gmx)   UserInputError (gmx)   
BooleanOption (gmx)   gmx_molblock_t   NbnxnPairlistCpu   SetPrecision (gmx)   
BooleanOptionInfo (gmx)   gmx_moltype_t   NbnxnPairlistCpuWork   SetStartTime (gmx)   
BoxDeformationHandle (gmx)   gmx_sparsematrix   NonbondedBenchmarkInfo (gmx)   SetTimeStep (gmx)   
  C  
GromacsException (gmx)   NormalDistribution (gmx)   SetVelocities (gmx)   
  I  
NotImplementedError (gmx)   SimulationAlgorithmSetupError (gmx)   
CheckpointData (gmx)   
  O  
SimulationGroups   
IAnalysisDataModule (gmx)   
OptionInfo (gmx)   
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