Gromacs  2023.3
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  A  
CommandLineParser (gmx)   NbnxnPairlistCpuWork::IClusterData   NbnxnPairlistCpu   SetVelocities (gmx)   
ConstraintsParam (gmx)   ICommandLineModule (gmx)   NbnxnPairlistCpuWork   SimulationAlgorithmSetupError (gmx)   
AbstractAnalysisArrayData (gmx)   ConvertTprInfo (gmx)   ICommandLineOptionsModule (gmx)   NonbondedBenchmarkInfo (gmx)   SimulationGroups   
AbstractAnalysisData (gmx)   CoulombCalculator (gmx)   ICommandLineOptionsModuleSettings (gmx)   NormalDistribution (gmx)   SimulationInputHandle   
AbstractAverageHistogram (gmx)   CoulombCalculator< KernelCoulombType::EwaldAnalytical > (gmx)   IdentityFormatter (gmx)   NotImplementedError (gmx)   SimulationInstabilityError (gmx)   
AbstractOption (gmx)   CoulombCalculator< KernelCoulombType::EwaldTabulated > (gmx)   IFrameConverter (gmx)   
  O  
SimulationParticle   
AbstractOptionSection (gmx)   CoulombCalculator< KernelCoulombType::RF > (gmx)   IListIterator   SimulationSignal (gmx)   
AbstractOptionSectionHandle (gmx)   
  D  
IListProxy   OptionInfo (gmx)   SimulationSignaller (gmx)   
AbstractPlotModule (gmx)   IListRange   Options (gmx)   SimulatorConfig (gmx)   
AmdPackedFloat3   DataFileFinder (gmx)   InconsistentInputError (gmx)   OptionSection (gmx)   SimulatorEnv (gmx)   
AnalysisArrayData (gmx)   DataFileInfo (gmx)   IndexGroup   OptionSectionHandle (gmx)   SimulatorStateData (gmx)   
AnalysisData (gmx)   DataFileOptions (gmx)   InstallationPrefixInfo (gmx)   OptionTemplate (gmx)   StaticLog2 (gmx)   
AnalysisDataAverageModule (gmx)   df_history_t   Int64Option (gmx)   OutputRequirementOptionDirector (gmx)   StaticLog2< 0 > (gmx)   
AnalysisDataBinAverageModule (gmx)   DiagonalMasker (gmx)   Int64OptionInfo (gmx)   OutputRequirements (gmx)   StaticLog2< 1 > (gmx)   
AnalysisDataDisplacementModule (gmx)   DiagonalMasker< nR, kernelLayout, DiagonalMaskType::JSizeEqualsISize > (gmx)   IntegerOption (gmx)   OutputSelector (gmx)   StringFormatter (gmx)   
AnalysisDataFrameAverageModule (gmx)   DiagonalMasker< nR, kernelLayout, DiagonalMaskType::JSizeIsDoubleISize > (gmx)   IntegerOptionInfo (gmx)   
  P  
StringOption (gmx)   
AnalysisDataFrameHeader (gmx)   DiagonalMasker< nR, kernelLayout, DiagonalMaskType::JSizeIsHalfISize > (gmx)   InteractionListHandle   StringOptionInfo (gmx)   
AnalysisDataFrameRef (gmx)   Grid::Dimensions (Nbnxm)   InteractiveMD (gmx)   PackedJClusterList   StringTable   
AnalysisDataHandle (gmx)   DoubleOption (gmx)   InternalError (gmx)   PaddedVector (gmx)   StringTableEntry   
AnalysisDataLifetimeModule (gmx)   DoubleOptionInfo (gmx)   InvalidInputError (gmx)   PaddingTraits (gmx::detail)   StringToEnumValueConverter (gmx)   
AnalysisDataModuleParallel (gmx)   
  E  
IonSwapping (gmx)   PairlistSets   
  T  
AnalysisDataModuleSerial (gmx)   IOptionManager (gmx)   PairSearch   
AnalysisDataPlotModule (gmx)   ElementNotFoundError (gmx)   IOptionsBehavior (gmx)   PairsearchWork   t_filenm   
AnalysisDataPlotSettings (gmx)   EnergyFunctionProperties (Nbnxm)   IOptionsContainer (gmx)   ParallelConsistencyError (gmx)   t_mapping   
AnalysisDataPointSetRef (gmx)   EnumOption (gmx)   IOptionsContainerWithSections (gmx)   UniformRealDistribution::param_type (gmx)   t_matrix   
AnalysisDataSimpleHistogramModule (gmx)   EnumOptionInfo (gmx)   IOutputAdapter (gmx)   UniformIntDistribution::param_type (gmx)   t_mdatoms   
AnalysisDataValue (gmx)   EqualCaseInsensitive (gmx)   IProgramContext (gmx)   TabulatedNormalDistribution::param_type (gmx)   t_oriresdata   
AnalysisDataVectorPlotModule (gmx)   ExceptionInfo (gmx)   IRestraintPotential (gmx)   NormalDistribution::param_type (gmx)   t_pargs   
AnalysisDataWeightedHistogramModule (gmx)   ExceptionInitializer (gmx)   IsSerializableEnum (gmx)   GammaDistribution::param_type (gmx)   t_pbc   
AnalysisHistogramSettings (gmx)   ExponentialDistribution (gmx)   Range::iterator (gmx)   ExponentialDistribution::param_type (gmx)   t_state   
AnalysisHistogramSettingsInitializer (gmx)   
  F  
ITopologyProvider (gmx)   PartialDeserializedTprFile   t_xpmelmt   
AnalysisNeighborhood (gmx)   
  J  
PbcAiuc   TabulatedNormalDistribution (gmx)   
AnalysisNeighborhoodPair (gmx)   FEPStateValue   PdbAtomEntry   TextLineWrapper (gmx)   
AnalysisNeighborhoodPairSearch (gmx)   FileIOError (gmx)   JClusterList   PotentialPointData (gmx)   TextLineWrapperSettings (gmx)   
AnalysisNeighborhoodPositions (gmx)   FileNameOption (gmx)   
  L  
ProcessFrameConversion (gmx)   ThreeFry2x64 (gmx)   
AnalysisNeighborhoodSearch (gmx)   FileNameOptionInfo (gmx)   Profiling (gmx)   ThreeFry2x64Fast (gmx)   
APIError (gmx)   FileNameOptionManager (gmx)   LegacyEnumOption (gmx)   PullCoordExpressionParser (gmx)   ThreeFry2x64General (gmx)   
ArrayRef (gmx)   FixedCapacityVector (gmx)   LegacyInput (gmx)   
  R  
TimeUnitBehavior (gmx)   
ArrayRefWithPadding (gmx)   FlagsTemplate (gmx)   LennardJonesCalculator (gmx)   TimeUnitManager (gmx)   
AtomIterator   FloatOption (gmx)   LennardJonesCalculator< calculateEnergies, InteractionModifiers::ForceSwitch > (gmx)   Range (gmx)   ToleranceError (gmx)   
AtomPair (gmx)   FloatOptionInfo (gmx)   LennardJonesCalculator< calculateEnergies, InteractionModifiers::PotSwitch > (gmx)   RangeError (gmx)   TopologyData (gmx)   
AtomProperties   ForceHelperBuffers   LennardJonesCalculator< false, InteractionModifiers::PotShift > (gmx)   RangePartitioning (gmx)   TrajectoryAnalysisCommandLineRunner (gmx)   
AtomProxy   ForeignLambdaTerms   LennardJonesCalculator< true, InteractionModifiers::PotShift > (gmx)   RepeatingOptionSection (gmx)   TrajectoryAnalysisModule (gmx)   
AtomRange   
  G  
ListOfLists (gmx)   RepeatingOptionSectionHandle (gmx)   TrajectoryAnalysisModuleData (gmx)   
AtomsAdjacencyListElement   LocalSettleData   
  S  
TrajectoryAnalysisSettings (gmx)   
  B  
GammaDistribution (gmx)   
  M  
TrajectoryFileOpener (gmx)   
gmx_ana_index_t   Selection (gmx)   TrajectoryFrameWriter (gmx)   
BalanceRegion   gmx_ana_indexmap_t   MembedHolder (gmx)   SelectionCollection (gmx)   
  U  
BasicVector (gmx)   gmx_ana_pos_t   MissingElementConnectionError (gmx)   SelectionOption (gmx)   
BenchmarkSystem (gmx)   gmx_cache_protect_t   ModularSimulatorError (gmx)   SelectionOptionBehavior (gmx)   UniformIntDistribution (gmx)   
BooleanOption (gmx)   gmx_domdec_constraints_t   MoleculeBlockIndices   SelectionOptionInfo (gmx)   UniformRealDistribution (gmx)   
BooleanOptionInfo (gmx)   gmx_enerdata_t   MtsLevel (gmx)   SelectionOptionManager (gmx)   UserInputError (gmx)   
BoolType (gmx)   gmx_ffparams_t   
  N  
SelectionPosition (gmx)   
  W  
BoxDeformationHandle (gmx)   gmx_localtop_t   SelectionTopologyProperties (gmx)   
  C  
gmx_molblock_t   NbnxmKernel   SetAtoms (gmx)   WarningHandler   
gmx_moltype_t   nbnxn_cj_packed_t   SetBox (gmx)   WaterMolecule   
CheckpointData (gmx)   gmx_nodecomm_t   nbnxn_cj_t   SetForces (gmx)   
CheckpointError (gmx)   gmx_sparsematrix   nbnxn_cycle_t   SetPrecision (gmx)   
CheckpointHeaderContents   GromacsException (gmx)   nbnxn_excl_t   SetStartTime (gmx)   
CommandLineHelpWriter (gmx)   GromppMtsOpts (gmx)   nbnxn_im_ei_t   SetTimeStep (gmx)   
CommandLineModuleSettings (gmx)   
  I  
nbnxn_sci   SettleWaterTopology   
IAnalysisDataModule (gmx)   
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