- g -
- ga2la_change_la()
: ga2la.h
- ga2la_clear()
: ga2la.h
- ga2la_del()
: ga2la.h
- ga2la_get()
: ga2la.h
- ga2la_get_home()
: ga2la.h
- ga2la_init()
: ga2la.h
- ga2la_is_home()
: ga2la.h
- ga2la_set()
: ga2la.h
- get()
: parser_internal.h
- get_a_line()
: strdb.h
- get_acffitfn()
: autocorr.cpp
, autocorr.h
- get_acfnout()
: autocorr.cpp
, autocorr.h
- get_center()
: groupcoord.h
- get_center_comm()
: groupcoord.h
- get_cgcm_mol()
: domdec_topology.cpp
- get_compartment_boundaries()
: swapcoords.cpp
- get_current_cuda_gpu_device_id()
: gpu_utils.h
- get_f_norm_max()
: minimize.cpp
- get_gpu_device_info_string()
: gpu_utils.h
, gpu_utils_ocl.cpp
- get_group_apm_check()
: swapcoords.cpp
- get_header()
: strdb.h
- get_index_of_distant_atom()
: swapcoords.cpp
- get_initial_ioncounts()
: swapcoords.cpp
- get_initial_ioncounts_from_cpt()
: swapcoords.cpp
- get_lines()
: strdb.h
- get_molecule_center()
: swapcoords.cpp
- get_nthreads_mpi()
: resourcedivision.cpp
, resourcedivision.h
- get_pme_ddranks()
: domdec.h
- get_pme_nnodes()
: domdec.h
- get_pull_coord_value()
: pull.h
- get_state_f_norm_max()
: minimize.cpp
- get_sum_of_positions()
: groupcoord.h
- get_tmpi_omp_thread_division()
: resourcedivision.cpp
- get_vendor_id()
: gpu_utils_ocl.cpp
- getCompatibleGpus()
: gpu_utils.cpp
, gpu_utils.h
, gpu_utils_ocl.cpp
- getDeviceInfo()
: gpu_utils.h
, gpu_utils_ocl.cpp
- getFilenm()
: filenm.h
- getGpuAtomRange()
: nbnxn_gpu_common.h
- getGpuCompatibilityDescription()
: gpu_utils.cpp
, gpu_utils.h
, gpu_utils_ocl.cpp
- getGpuImplementationString()
: baseversion.h
- getOclPruneKernelJ4Concurrency()
: nbnxn_ocl_types.h
- getRandomIntArray()
: gmx_wham.cpp
- getRequestedChargeImbalance()
: swapcoords.cpp
- glatnr()
: listed-internal.cpp
, listed-internal.h
- global_atomnr_to_moltype_ind()
: domdec_topology.cpp
- global_max()
: tpi.cpp
- gmx_abort()
: basenetwork.h
- gmx_ana_index_check_range()
: indexutil.cpp
, indexutil.h
- gmx_ana_index_check_sorted()
: indexutil.cpp
, indexutil.h
- gmx_ana_index_clear()
: indexutil.cpp
, indexutil.h
- gmx_ana_index_contains()
: indexutil.cpp
, indexutil.h
- gmx_ana_index_copy()
: indexutil.cpp
, indexutil.h
- gmx_ana_index_deinit()
: indexutil.cpp
, indexutil.h
- gmx_ana_index_difference()
: indexutil.cpp
, indexutil.h
- gmx_ana_index_difference_size()
: indexutil.cpp
, indexutil.h
- gmx_ana_index_dump()
: indexutil.cpp
, indexutil.h
- gmx_ana_index_equals()
: indexutil.cpp
, indexutil.h
- gmx_ana_index_get_max_index()
: indexutil.cpp
, indexutil.h
- gmx_ana_index_has_complete_elems()
: indexutil.cpp
, indexutil.h
- gmx_ana_index_has_full_ablocks()
: indexutil.cpp
, indexutil.h
- gmx_ana_index_has_full_blocks()
: indexutil.cpp
, indexutil.h
- gmx_ana_index_init_simple()
: indexutil.cpp
, indexutil.h
- gmx_ana_index_intersection()
: indexutil.cpp
, indexutil.h
- gmx_ana_index_make_block()
: indexutil.cpp
, indexutil.h
- gmx_ana_index_merge()
: indexutil.cpp
, indexutil.h
- gmx_ana_index_partition()
: indexutil.cpp
, indexutil.h
- gmx_ana_index_remove_duplicates()
: indexutil.cpp
, indexutil.h
- gmx_ana_index_reserve()
: indexutil.cpp
, indexutil.h
- gmx_ana_index_set()
: indexutil.cpp
, indexutil.h
- gmx_ana_index_sort()
: indexutil.cpp
, indexutil.h
- gmx_ana_index_squeeze()
: indexutil.cpp
, indexutil.h
- gmx_ana_index_union()
: indexutil.cpp
, indexutil.h
- gmx_ana_index_union_unsorted()
: indexutil.cpp
, indexutil.h
- gmx_ana_indexgrps_extract()
: indexutil.cpp
, indexutil.h
- gmx_ana_indexgrps_find()
: indexutil.cpp
, indexutil.h
- gmx_ana_indexgrps_free()
: indexutil.cpp
, indexutil.h
- gmx_ana_indexgrps_get_grp()
: indexutil.cpp
, indexutil.h
- gmx_ana_indexgrps_init()
: indexutil.cpp
, indexutil.h
- gmx_ana_indexgrps_is_empty()
: indexutil.cpp
, indexutil.h
- gmx_ana_indexgrps_print()
: indexutil.cpp
, indexutil.h
- gmx_ana_indexmap_clear()
: indexutil.cpp
, indexutil.h
- gmx_ana_indexmap_copy()
: indexutil.cpp
, indexutil.h
- gmx_ana_indexmap_deinit()
: indexutil.cpp
, indexutil.h
- gmx_ana_indexmap_init()
: indexutil.cpp
, indexutil.h
- gmx_ana_indexmap_init_orgid_group()
: indexutil.cpp
, indexutil.h
- gmx_ana_indexmap_reserve()
: indexutil.cpp
, indexutil.h
- gmx_ana_indexmap_set_static()
: indexutil.cpp
, indexutil.h
- gmx_ana_indexmap_update()
: indexutil.cpp
, indexutil.h
- gmx_ana_pos_add_to_group()
: position.cpp
, position.h
- gmx_ana_pos_append()
: position.cpp
, position.h
- gmx_ana_pos_append_finish()
: position.cpp
, position.h
- gmx_ana_pos_append_init()
: position.cpp
, position.h
- gmx_ana_pos_copy()
: position.cpp
, position.h
- gmx_ana_pos_empty()
: position.cpp
, position.h
- gmx_ana_pos_empty_init()
: position.cpp
, position.h
- gmx_ana_pos_init_const()
: position.cpp
, position.h
- gmx_ana_pos_reserve()
: position.cpp
, position.h
- gmx_ana_pos_reserve_for_append()
: position.cpp
, position.h
- gmx_ana_pos_reserve_forces()
: position.cpp
, position.h
- gmx_ana_pos_reserve_velocities()
: position.cpp
, position.h
- gmx_ana_pos_set_nr()
: position.cpp
, position.h
- gmx_ana_poscalc_free()
: poscalc.cpp
, poscalc.h
- gmx_ana_poscalc_init_pos()
: poscalc.cpp
, poscalc.h
- gmx_ana_poscalc_required_topology_info()
: poscalc.cpp
, poscalc.h
- gmx_ana_poscalc_set_flags()
: poscalc.cpp
, poscalc.h
- gmx_ana_poscalc_set_maxindex()
: poscalc.cpp
, poscalc.h
- gmx_ana_poscalc_update()
: poscalc.cpp
, poscalc.h
- gmx_ana_selmethod_find_param()
: selmethod.cpp
, selmethod.h
- gmx_ana_selmethod_register()
: selmethod.cpp
, selmethod.h
- gmx_ana_selmethod_register_defaults()
: selmethod.cpp
, selmethod.h
- gmx_ana_selparam_find()
: params.cpp
, selparam.h
- gmx_awh()
: gmx_awh.cpp
- gmx_broadcast_world()
: basenetwork.h
- gmx_calc_cog()
: centerofmass.cpp
, centerofmass.h
- gmx_calc_cog_block()
: centerofmass.cpp
, centerofmass.h
- gmx_calc_cog_f()
: centerofmass.cpp
, centerofmass.h
- gmx_calc_cog_f_block()
: centerofmass.cpp
, centerofmass.h
- gmx_calc_cog_pbc()
: centerofmass.cpp
, centerofmass.h
- gmx_calc_com()
: centerofmass.h
, centerofmass.cpp
- gmx_calc_com_block()
: centerofmass.cpp
, centerofmass.h
- gmx_calc_com_f()
: centerofmass.h
, centerofmass.cpp
- gmx_calc_com_f_block()
: centerofmass.cpp
, centerofmass.h
- gmx_calc_com_pbc()
: centerofmass.h
, centerofmass.cpp
- gmx_calc_comg()
: centerofmass.cpp
, centerofmass.h
- gmx_calc_comg_block()
: centerofmass.cpp
, centerofmass.h
- gmx_calc_comg_blocka()
: centerofmass.cpp
, centerofmass.h
- gmx_calc_comg_f()
: centerofmass.h
, centerofmass.cpp
- gmx_calc_comg_f_block()
: centerofmass.cpp
, centerofmass.h
- gmx_calc_comg_f_blocka()
: centerofmass.h
, centerofmass.cpp
- gmx_calc_comg_pbc()
: centerofmass.cpp
, centerofmass.h
- gmx_chdir()
: futil.h
- gmx_check_thread_affinity_set()
: threadaffinity.h
- gmx_ctime_r()
: sysinfo.cpp
, sysinfo.h
- gmx_cycles_calibrate()
: cyclecounter.h
- gmx_cycles_have_counter()
: cyclecounter.h
- gmx_cycles_read()
: cyclecounter.h
- gmx_disable_file_buffering()
: futil.h
- gmx_exit_on_fatal_error()
: fatalerror.h
- gmx_fatal()
: fatalerror.h
- gmx_fatal_mpi_va()
: fatalerror.h
- gmx_fatal_set_log_file()
: fatalerror.h
- gmx_fexist()
: futil.h
- gmx_ffclose()
: futil.h
- gmx_ffopen()
: futil.h
- gmx_fft_1d()
: fft.h
- gmx_fft_1d_real()
: fft.h
- gmx_fft_2d_real()
: fft.h
- gmx_fft_cleanup()
: fft.h
- gmx_fft_destroy()
: fft.h
- gmx_fft_init_1d()
: fft.h
- gmx_fft_init_1d_real()
: fft.h
- gmx_fft_init_2d_real()
: fft.h
- gmx_fft_init_many_1d()
: fft.h
- gmx_fft_init_many_1d_real()
: fft.h
- gmx_fft_many_1d()
: fft.h
- gmx_fft_many_1d_real()
: fft.h
- gmx_fft_transpose_2d()
: fft.h
- gmx_file_copy()
: futil.h
- gmx_file_rename()
: futil.h
- gmx_fio_lock()
: gmxfio-impl.h
- gmx_fio_unlock()
: gmxfio-impl.h
- gmx_fopen_temporary()
: futil.h
- gmx_format_current_time()
: sysinfo.h
, sysinfo.cpp
- gmx_fseek()
: futil.h
- gmx_fsync()
: futil.h
- gmx_ftell()
: futil.h
- gmx_getcwd()
: futil.h
- gmx_gethostname()
: sysinfo.cpp
, sysinfo.h
- gmx_getpid()
: sysinfo.cpp
, sysinfo.h
- gmx_getuid()
: sysinfo.h
, sysinfo.cpp
- gmx_getusername()
: sysinfo.h
, sysinfo.cpp
- gmx_hash_change_or_set()
: hash.h
- gmx_hash_change_value()
: hash.h
- gmx_hash_clear()
: hash.h
- gmx_hash_clear_and_optimize()
: hash.h
- gmx_hash_del()
: hash.h
- gmx_hash_get()
: hash.h
- gmx_hash_get_minone()
: hash.h
- gmx_hash_init()
: hash.h
- gmx_hash_realloc()
: hash.h
- gmx_hash_set()
: hash.h
- gmx_init_debug()
: fatalerror.h
- gmx_int64_to_int()
: int64_to_int.h
- gmx_is_double_precision()
: baseversion.h
- gmx_is_single_precision()
: baseversion.h
- gmx_lmcurve()
: gmx_lmcurve.h
, gmx_lmcurve.cpp
- gmx_many_fft_destroy()
: fft.h
- gmx_mdrun()
: mdrun.cpp
- gmx_mpi_initialized()
: basenetwork.h
- gmx_node_num()
: basenetwork.h
- gmx_node_rank()
: basenetwork.h
- gmx_omp_check_thread_affinity()
: gmxomp.cpp
, gmxomp.h
- gmx_omp_get_max_threads()
: gmxomp.cpp
, gmxomp.h
- gmx_omp_get_num_procs()
: gmxomp.h
, gmxomp.cpp
- gmx_omp_get_thread_num()
: gmxomp.cpp
, gmxomp.h
- gmx_omp_set_num_threads()
: gmxomp.cpp
, gmxomp.h
- gmx_pause()
: gmxomp.h
- gmx_physicalnode_id_hash()
: basenetwork.h
- gmx_pme_calc_energy()
: pme.h
, pme.cpp
- gmx_pme_check_restrictions()
: pme.cpp
, pme.h
- gmx_pme_destroy()
: pme.h
, pme.cpp
- gmx_pme_do()
: pme.cpp
, pme.h
- gmx_pme_init()
: pme.h
, pme.cpp
- gmx_pme_receive_f()
: pme.h
, pme-pp.cpp
- gmx_pme_reinit()
: pme.cpp
, pme-internal.h
- gmx_pme_reinit_atoms()
: pme.h
, pme.cpp
- gmx_pme_send_coeffs_coords()
: pme-pp.cpp
- gmx_pme_send_coeffs_coords_wait()
: pme-pp.cpp
- gmx_pme_send_coordinates()
: pme.h
, pme-pp.cpp
- gmx_pme_send_finish()
: pme-pp.cpp
, pme.h
- gmx_pme_send_parameters()
: pme-pp.cpp
, pme.h
- gmx_pme_send_resetcounters()
: pme.h
, pme-pp.cpp
- gmx_pme_send_switchgrid()
: pme-pp.cpp
, pme-internal.h
- gmx_pmeonly()
: pme.h
- gmx_qsort()
: qsort_threadsafe.h
- gmx_run_cmain()
: cmdlineinit.h
, cmdlineinit.cpp
- gmx_set_error_handler()
: fatalerror.h
- gmx_set_max_backup_count()
: futil.h
- gmx_set_nice()
: sysinfo.h
, sysinfo.cpp
- gmx_set_thread_affinity()
: threadaffinity.h
- gmx_sfree_aligned_impl()
: smalloc.h
- gmx_sfree_impl()
: smalloc.h
- gmx_smalloc_impl()
: smalloc.h
- gmx_snew_aligned_impl()
: smalloc.h
- gmx_snew_impl()
: smalloc.h
- gmx_srenew_impl()
: smalloc.h
- gmx_stats_add_point()
: statistics.h
- gmx_stats_add_points()
: statistics.h
- gmx_stats_dump_xy()
: statistics.h
- gmx_stats_free()
: statistics.h
- gmx_stats_get_a()
: statistics.h
- gmx_stats_get_ab()
: statistics.h
- gmx_stats_get_ase()
: statistics.h
- gmx_stats_get_average()
: statistics.h
- gmx_stats_get_corr_coeff()
: statistics.h
- gmx_stats_get_error()
: statistics.h
- gmx_stats_get_npoints()
: statistics.h
- gmx_stats_get_point()
: statistics.h
- gmx_stats_get_rmsd()
: statistics.h
- gmx_stats_get_sigma()
: statistics.h
- gmx_stats_init()
: statistics.h
- gmx_stats_make_histogram()
: statistics.h
- gmx_stats_message()
: statistics.h
- gmx_stats_remove_outliers()
: statistics.h
- gmx_step_str()
: cstringutil.h
- gmx_strcasecmp()
: cstringutil.h
- gmx_strcasecmp_min()
: cstringutil.h
- gmx_strdup()
: cstringutil.h
- gmx_string_fullhash_func()
: cstringutil.h
- gmx_string_hash_func()
: cstringutil.h
- gmx_strncasecmp()
: cstringutil.h
- gmx_strncasecmp_min()
: cstringutil.h
- gmx_strndup()
: cstringutil.h
- gmx_tmpnam()
: futil.h
- gmx_truncate()
: futil.h
- gmx_version()
: baseversion.h
- gmx_version_git_central_base_hash()
: baseversion.h
- gmx_version_git_full_hash()
: baseversion.h
- gmx_warning()
: fatalerror.h
- gmx_wcmatch()
: cstringutil.h
- gmx_wham()
: gmx_wham.cpp
- gmxlibfn()
: futil.h
- gmxSmtIsEnabled()
: resourcedivision.cpp
- gpu_set_host_malloc_and_free()
: gpu_utils_ocl.cpp
, gpu_utils.h
, gpu_utils.cpp
- gpuAtomToInteractionLocality()
: nbnxn_gpu_common.h
- gpuStreamSynchronize()
: oclutils.h
- guess_ePBC()
: pbc.cpp
- guess_npme()
: domdec_setup.cpp
- guessPotByIntegration()
: gmx_wham.cpp