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  A  
ConfMatch (gmx::test)   IFileInputRedirector (gmx)   NumericalSplineTableInput (gmx)   SimdTraits (gmx::internal)   
Constraints (gmx)   IFileMatcher (gmx::test)   NumPmeDomains   SimpleHelpTopic (gmx)   
AbstractAnalysisArrayData (gmx)   HardwareTopology::Core (gmx)   IFileMatcherSettings (gmx::test)   
  O  
SimulationContext (gmx)   
AbstractAnalysisData (gmx)   CpuInfo (gmx)   IFileOutputRedirector (gmx)   SimulationInstabilityError (gmx)   
AbstractAverageHistogram (gmx)   CubicSplineTable (gmx)   IForceProvider (gmx)   ObservablesHistory   SimulationSignal (gmx)   
AbstractCompositeHelpTopic (gmx)   
  D  
IHelpTopic (gmx)   OptionInfo (gmx)   SimulationSignaller (gmx)   
AbstractOption (gmx)   IKeyValueTreeTransformRules (gmx)   OptionManagerContainer (gmx)   Site (gmx)   
AbstractOptionSection (gmx)   DataFileFinder (gmx)   ILogTarget (gmx)   Options (gmx)   HardwareTopology::Socket (gmx)   
AbstractOptionSectionHandle (gmx)   DataFileInfo (gmx)   IMDModule (gmx)   OptionsAssigner (gmx)   StandardInputStream (gmx)   
AbstractOptionStorage (gmx)   DataFileOptions (gmx)   IMDOutputProvider (gmx)   OptionsBehaviorCollection (gmx)   StaticLog2 (gmx)   
AbstractPlotModule (gmx)   HardwareTopology::Device (gmx)   IMdpOptionProvider (gmx)   OptionSection (gmx)   StaticLog2< 0 > (gmx)   
AbstractSimpleHelpTopic (gmx)   df_history_t   InconsistentInputError (gmx)   OptionSectionHandle (gmx)   StaticLog2< 1 > (gmx)   
KeyValueTreeTransformRuleBuilder::AfterFrom (gmx)   DirectoryEnumerator (gmx)   InstallationPrefixInfo (gmx)   OptionsIterator (gmx)   StdioTestHelper (gmx::test)   
AlignedAllocationPolicy (gmx)   DomdecOptions   Int64Option (gmx)   OptionsModifyingIterator (gmx)   StopConditionSignal (gmx)   
AlignedArray< double, N > (gmx)   DoubleOption (gmx)   Int64OptionInfo (gmx)   OptionsModifyingTypeVisitor (gmx)   StopConditionTime (gmx)   
AlignedArray< float, N > (gmx)   DoubleOptionInfo (gmx)   IntegerOption (gmx)   OptionsModifyingVisitor (gmx)   StopHandler (gmx)   
Allocator (gmx)   
  E  
IntegerOptionInfo (gmx)   OptionStorageTemplate (gmx)   StopHandlerBuilder (gmx)   
AllocatorTest (gmx::test)   InteractionListHandle   OptionStorageTemplateSimple (gmx)   StringCompare (gmx)   
AnalysisArrayData (gmx)   ekinstate_t   InteractiveTestHelper (gmx::test)   OptionsTypeVisitor (gmx)   StringFormatter (gmx)   
AnalysisData (gmx)   EmptyArrayRef (gmx)   InternalError (gmx)   OptionsVisitor (gmx)   StringInputStream (gmx)   
AnalysisDataAverageModule (gmx)   gmx_ga2la_t::Entry   InvalidInputError (gmx)   OptionTemplate (gmx)   StringOption (gmx)   
AnalysisDataBinAverageModule (gmx)   EnumOption (gmx)   IOptionManager (gmx)   OptionValueConverterSimple (gmx)   StringOptionInfo (gmx)   
AnalysisDataDisplacementModule (gmx)   EnumOptionInfo (gmx)   IOptionsBehavior (gmx)   
  P  
StringOutputStream (gmx)   
AnalysisDataFrameAverageModule (gmx)   EwaldBoxZScaler   IOptionsContainer (gmx)   StringTestBase (gmx::test)   
AnalysisDataFrameHeader (gmx)   ExactTextMatch (gmx::test)   IOptionsContainerWithSections (gmx)   PaddedVector (gmx)   
  T  
AnalysisDataFrameRef (gmx)   ExceptionInfo (gmx)   IProgramContext (gmx)   PaddingTraits (gmx::detail)   
AnalysisDataHandle (gmx)   ExceptionInitializer (gmx)   IRestraintPotential (gmx)   PageAlignedAllocationPolicy (gmx)   t_filenm   
AnalysisDataLifetimeModule (gmx)   ExponentialDistribution (gmx)   ISerializer (gmx)   UniformRealDistribution::param_type (gmx)   t_mdatoms   
AnalysisDataModuleManager (gmx)   
  F  
isIntegralConstant (gmx)   UniformIntDistribution::param_type (gmx)   t_pargs   
AnalysisDataModuleParallel (gmx)   RangePartitioning::Block::iterator (gmx)   TabulatedNormalDistribution::param_type (gmx)   t_pbc   
AnalysisDataModuleSerial (gmx)   FileIOError (gmx)   ITextBlockMatcher (gmx::test)   NormalDistribution::param_type (gmx)   t_state   
AnalysisDataParallelOptions (gmx)   FileNameOption (gmx)   ITextBlockMatcherSettings (gmx::test)   GammaDistribution::param_type (gmx)   TabulatedNormalDistribution (gmx)   
AnalysisDataPlotModule (gmx)   FileNameOptionInfo (gmx)   ITopologyProvider (gmx)   ExponentialDistribution::param_type (gmx)   TestException (gmx::test)   
AnalysisDataPlotSettings (gmx)   FileNameOptionManager (gmx)   
  K  
PhysicalNodeCommunicator (gmx)   TestFileInputRedirector (gmx::test)   
AnalysisDataPointSetRef (gmx)   FilteringExactTextMatch (gmx::test)   PotentialPointData (gmx)   TestFileManager (gmx::test)   
AnalysisDataSimpleHistogramModule (gmx)   FlagsTemplate (gmx)   KeyValueTreeBuilder (gmx)   PrivateImplPointer (gmx)   TestFileOutputRedirector (gmx::test)   
AnalysisDataStorage (gmx)   FloatingPointDifference (gmx::test)   KeyValueTreeObjectArrayBuilder (gmx)   
  Q  
TestOptionsProvider (gmx::test)   
AnalysisDataStorageFrame (gmx)   FloatingPointTolerance (gmx::test)   KeyValueTreeObjectBuilder (gmx)   TestReferenceChecker (gmx::test)   
AnalysisDataTestFixture (gmx::test)   FloatOption (gmx)   KeyValueTreePath (gmx)   QuadraticSplineTable (gmx)   TestReferenceData (gmx::test)   
AnalysisDataTestInput (gmx::test)   FloatOptionInfo (gmx)   KeyValueTreeTransformRuleBuilder (gmx)   
  R  
TextFileMatch (gmx::test)   
AnalysisDataTestInputFrame (gmx::test)   ForceProviderInput (gmx)   KeyValueTreeTransformRulesScoped (gmx)   TextInputFile (gmx)   
AnalysisDataTestInputPointSet (gmx::test)   ForceProviderOutput (gmx)   KeyValueTreeUniformArrayBuilder (gmx)   RangeError (gmx)   TextInputStream (gmx)   
AnalysisDataValue (gmx)   ForceProviders   KeyValueTreeValueBuilder (gmx)   RangePartitioning (gmx)   TextLineWrapper (gmx)   
AnalysisDataVectorPlotModule (gmx)   ForceWithVirial (gmx)   
  L  
Regex (gmx)   TextLineWrapperSettings (gmx)   
AnalysisDataWeightedHistogramModule (gmx)   
  G  
RepeatingOptionSection (gmx)   TextOutputFile (gmx)   
AnalysisHistogramSettings (gmx)   LegacyMdrunOptions (gmx)   RepeatingOptionSectionHandle (gmx)   TextOutputStream (gmx)   
AnalysisHistogramSettingsInitializer (gmx)   GammaDistribution (gmx)   LocalAtomSet (gmx)   ReplicaExchangeParameters   TextReader (gmx)   
AnalysisNeighborhood (gmx)   GlobalCommandLineHelpContext (gmx)   LocalAtomSetManager (gmx)   ResetHandler (gmx)   TextTableFormatter (gmx)   
AnalysisNeighborhoodPair (gmx)   gmx_ana_index_t   LogEntryWriter (gmx)   RestraintManager (gmx)   TextWriter (gmx)   
AnalysisNeighborhoodPairSearch (gmx)   gmx_ana_indexmap_t   LoggerBuilder (gmx)   RestraintMDModule (gmx)   ThreeFry2x64 (gmx)   
AnalysisNeighborhoodPositions (gmx)   gmx_ana_pos_t   LoggerOwner (gmx)   
  S  
ThreeFry2x64Fast (gmx)   
AnalysisNeighborhoodSearch (gmx)   gmx_ffparams_t   LoggerTestHelper (gmx::test)   ThreeFry2x64General (gmx)   
AnalyticalSplineTableInput (gmx)   gmx_ga2la_t   HardwareTopology::LogicalProcessor (gmx)   Selection (gmx)   TimeUnitBehavior (gmx)   
APIError (gmx)   gmx_molblock_t   CpuInfo::LogicalProcessor (gmx)   SelectionCollection (gmx)   TimeUnitManager (gmx)   
ArrayRef (gmx)   gmx_moltype_t   LogLevelHelper (gmx)   SelectionFileOption (gmx)   ToleranceError (gmx)   
Awh (gmx)   gmx_sparsematrix   
  M  
SelectionFileOptionInfo (gmx)   KeyValueTreeTransformRuleBuilder::ToObject (gmx)   
  B  
GpuEventSynchronizer   SelectionOption (gmx)   TopologyInformation (gmx)   
GpuRegionTimerImpl   HardwareTopology::Machine (gmx)   SelectionOptionBehavior (gmx)   KeyValueTreeTransformRuleBuilder::ToValue (gmx)   
BasicVector (gmx)   GpuRegionTimerWrapper   MappedUnionFinder (gmx)   SelectionOptionInfo (gmx)   TrajectoryAnalysisCommandLineRunner (gmx)   
BinaryInformationSettings (gmx)   GpuTaskMapping (gmx)   MDAtoms (gmx)   SelectionOptionManager (gmx)   TrajectoryAnalysisModule (gmx)   
RangePartitioning::Block (gmx)   GromacsException (gmx)   MDLogger (gmx)   SelectionPosition (gmx)   TrajectoryAnalysisModuleData (gmx)   
BooleanOption (gmx)   
  H  
MDModules (gmx)   SelectionTopologyProperties (gmx)   TrajectoryAnalysisSettings (gmx)   
BooleanOptionInfo (gmx)   Mdrunner (gmx)   Simd4DBool (gmx)   TypedClMemory   
  C  
HardwareTopology (gmx)   MdrunnerBuilder (gmx)   Simd4Double (gmx)   
  U  
HashedMap (gmx)   MessageStringCollector (gmx)   Simd4FBool (gmx)   
HardwareTopology::Cache (gmx)   HelpLinks (gmx)   MessageStringContext (gmx)   Simd4Float (gmx)   UniformIntDistribution (gmx)   
CheckpointHandler (gmx)   HelpManager (gmx)   MoleculeBlockIndices   SimdDBool (gmx)   UniformRealDistribution (gmx)   
ClfftInitializer (gmx)   HelpWriterContext (gmx)   
  N  
SimdDIBool (gmx)   UnionFinder (gmx)   
CommandLine (gmx::test)   history_t   SimdDInt32 (gmx)   UpdateGroupsCog (gmx)   
CommandLineHelpContext (gmx)   HostAllocationPolicy (gmx)   no_delete (gmx)   SimdDInt32Tag (gmx)   UserInputError (gmx)   
CommandLineHelpWriter (gmx)   HardwareTopology::HWThread (gmx)   NoContentsMatch (gmx::test)   SimdDouble (gmx)   
  V  
CommandLineModuleGroup (gmx)   
  I  
nonbonded_verlet_group_t   SimdDoubleTag (gmx)   
CommandLineModuleManager (gmx)   nonbonded_verlet_t   SimdFBool (gmx)   Variant (gmx)   
CommandLineModuleSettings (gmx)   IAnalysisDataModule (gmx)   NormalDistribution (gmx)   SimdFIBool (gmx)   
  X  
CommandLineParser (gmx)   ICommandLineModule (gmx)   not_null (gmx::compat)   SimdFInt32 (gmx)   
CommandLineProgramContext (gmx)   ICommandLineOptionsModule (gmx)   NoTextMatch (gmx::test)   SimdFInt32Tag (gmx)   XvgMatch (gmx::test)   
CommandLineTestBase (gmx::test)   ICommandLineOptionsModuleSettings (gmx)   NotImplementedError (gmx)   SimdFloat (gmx)   
CommandLineTestHelper (gmx::test)   IdentityFormatter (gmx)   HardwareTopology::Numa (gmx)   SimdFloatTag (gmx)   
CompositeHelpTopic (gmx)   IExecutableEnvironment (gmx)   HardwareTopology::NumaNode (gmx)   SimdSetZeroProxy (gmx)   
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