- c -

• c_avoidFloatingPointAtomics() : gmx
• calc_bounding_box() : gmx
• calc_dist_iter() : gmx
• calc_shmem_required_nonbonded() : gmx
• calc_shmem_required_prune() : gmx
• calcBoundingBoxHalves() : gmx
• calcBoundingBoxXPacked() : gmx
• calcPruneVerletBufferSize() : gmx
• calculateAcceptanceWeight() : gmx
• calculateLJEwaldC6Grid() : gmx
• canSkipNonbondedWork() : gmx
• canTreatPRScalingMatrixAsDiagonal() : gmx
• castOrNull() : gmx
• cbrt() : gmx
• centerTypeNames() : gmx
• changePinningPolicy() : gmx
• check_assign_connected() : gmx
• check_assign_triangle() : gmx
• check_cons() : gmx
• check_grid_jump() : gmx
• checkAwhParams() : gmx
• checkDeviceError() : gmx
• checkGpu() : gmx
• checkHardwareOversubscription() : gmx
• checkIfRandomDeviceIsFunctional() : gmx
• checkInputConsistencyInterval() : gmx
• checkKernelSetup() : gmx
• checkMpiCudaAwareSupport() : gmx
• checkMpiHipAwareSupport() : gmx
• checkMpiZEAwareSupport() : gmx
• checkMtsRequirements() : gmx
• checkpointVersion() : gmx
• checkPotentialEnergyValidity() : gmx
• checkUseModularSimulator() : gmx
• checkUserGpuIds() : gmx
• chooseAndLaunchNbnxmKernel() : gmx
• chooseAndLaunchNbnxmKernelPruneOnly() : gmx
• chooseLJCombinationRule() : gmx
• chooseLJPmeCombinationRule() : gmx
• cjFromCi() : gmx
• clear_constraint_quantity_nonlocal() : gmx
• clear_fshift() : gmx
• clearBufferAll() : gmx
• clearBufferFlagged() : gmx
• clearTaskForceBufferUsedElements() : gmx
• closeLogFile() : gmx
• clusterBoundingBoxDistance2() : gmx
• combine_bounding_box_pairs() : gmx
• combineMtsForces() : gmx
• computeDerivativeForTransformationPullCoord() : gmx
• computeExpectedNumGlobalBondedInteractions() : gmx
• computeFepPeriod() : gmx
• computeForceSwitchVariables() : gmx
• computeMaxUpdateGroupRadius() : gmx
• computePotentialSwitchVariables() : gmx
• computeQMBoxVec() : gmx
• computeSpecialForces() : gmx
• computeTotalSize() : gmx
• concatenateBeforeExtension() : gmx
• constr_iatomptr() : gmx
• constr_r_max() : gmx
• constr_r_max_moltype() : gmx
• constr_recur() : gmx
• constrain_coordinates() : gmx
• constrain_lincs() : gmx
• constrain_shake() : gmx
• constrain_velocities() : gmx
• constraintAtomRange() : gmx
• constraintGroupRadius() : gmx
• construct_vsites() : gmx
• construct_vsites_thread() : gmx
• constructVirtualSites() : gmx
• constructVirtualSitesGlobal() : gmx
• contains() : gmx
• convertFlag() : gmx
• convertIlistToNbnxnOrder() : gmx
• convertLJCombinationRule() : gmx
• convertSigmaEpsilonToC6C12() : gmx
• convertToCheckpointSignal() : gmx
• convertToResetSignal() : gmx
• convertToStopSignal() : gmx
• copy_rvec_to_nbat_real() : gmx
• copyOf() : gmx
• copyRVecToNbatPackedReal() : gmx
• copysign() : gmx
• cos() : gmx
• cosSingleAccuracy() : gmx
• count_triangle_constraints() : gmx
• countFlexibleConstraints() : gmx
• countInterUpdategroupVsites() : gmx
• countNonlinearVsites() : gmx
• countPruneKernelTime() : gmx
• countSamples() : gmx
• countTrailingZeroRows() : gmx
• countWords() : gmx
• cpuIsAmdZen1() : gmx
• cpuIsNeoverseV2() : gmx
• cpuIsX86Nehalem() : gmx
• crattle() : gmx
• create_unique_with_deleter() : gmx
• createElectricFieldModule() : gmx
• createGroup() : gmx
• createInteractiveMolecularDynamicsModule() : gmx
• createMatrix3x3FromLegacyMatrix() : gmx
• createSimulationWorkload() : gmx
• createSwapCoordinatesModule() : gmx
• createTrajectoryFrameWriter() : gmx
• cross() : gmx
• csettle() : gmx
• cshake() : gmx
• cuda_set_cacheconfig() : gmx
• currentLambdas() : gmx
• cvtB2IB() : gmx
• cvtD2F() : gmx
• cvtF2D() : gmx
• cvtI2R() : gmx
• cvtIB2B() : gmx
• cvtR2I() : gmx
• cvttR2I() : gmx