- s -

• sc_gpuClusterPairSplit() : gmx
• sc_gpuClusterPerSuperCluster() : gmx
• sc_gpuClusterSize() : gmx
• sc_gpuExclSize() : gmx
• sc_gpuJgroupSize() : gmx
• sc_gpuNumClusterPerCell() : gmx
• sc_gpuNumClusterPerCellX() : gmx
• sc_gpuNumClusterPerCellY() : gmx
• sc_gpuNumClusterPerCellZ() : gmx
• sc_gpuParallelExecutionWidth() : gmx
• sc_gpuSplitJClusterSize() : gmx
• sc_iClusterSize() : gmx
• sc_jClusterSize() : gmx
• sc_xStride() : gmx
• scaleByVector() : gmx
• scaleKernel() : gmx
• scalePositions() : gmx
• scaleVelocities() : gmx
• scan_edvec() : anonymous_namespace{edsam.cpp}
• select_nbnxn_kernel() : gmx
• selectBondedKernelFlavor() : anonymous_namespace{listed_forces.cpp}
• selectByMask() : gmx
• selectByNotMask() : gmx
• selectPruneKernel() : gmx
• serialize() : gmx::anonymous_namespace{mrcserializer.cpp}
• serializeAsInt32() : gmx::anonymous_namespace{mrcserializer.cpp}
• serializeCrystallographicSkewData() : gmx::anonymous_namespace{mrcserializer.cpp}
• serializeDistance() : gmx::anonymous_namespace{mrcserializer.cpp}
• serializeFEPStateValue() : anonymous_namespace{atoms.cpp}
• serializeIndex() : gmx::anonymous_namespace{mrcserializer.cpp}
• serializeIndices() : gmx::anonymous_namespace{mrcserializer.cpp}
• serializeKeyValueTree() : gmx
• serializeMrcDensityMapHeader() : gmx
• serializeValue() : anonymous_namespace{atoms.cpp}
• serializeValueType() : gmx::anonymous_namespace{keyvaluetreeserializer.cpp}
• series_sinhx() : gmx
• set_lincs() : gmx
• set_lincs_matrix() : gmx
• set_lincs_matrix_task() : gmx
• set_matrix_indices() : gmx
• setAndCheckMtsLevels() : gmx::test::anonymous_namespace{multipletimestepping.cpp}
• setAttribute() : gmx
• setBoxDeformationFlowMatrix() : gmx
• setCellAndAtomCount() : gmx
• setCoordinates() : anonymous_namespace{minimize.cpp}
• setDynamicPairlistPruningParameters() : gmx
• setEndianSwapBehaviorFromHost() : gmx::anonymous_namespace{inmemoryserializer.cpp}
• setFeatureFromBit() : gmx::anonymous_namespace{cpuinfo.cpp}
• setHistogramUpdateScaleFactors() : gmx::anonymous_namespace{biasstate.cpp}
• setICellCoordinatesSimd2xMM() : gmx
• setICellCoordinatesSimd4xM() : gmx
• setLibraryFileFinder() : gmx
• setNeighborsOfGridPoint() : gmx::anonymous_namespace{biasgrid.cpp}
• setProgramContext() : gmx
• setReductionMaskFromFepPairlist() : gmx::anonymous_namespace{freeenergydispatch.cpp}
• setSerialExpectationForParallelDataStarted() : gmx::test::anonymous_namespace{mock_datamodule.cpp}
• setStateDependentAwhParams() : gmx
• setStateDependentAwhPullDimParams() : gmx
• settle_proj() : gmx
• settleKernel() : gmx
• settleParameters() : gmx
• settleTemplate() : gmx
• settleTemplateWrapper() : gmx
• setup_edi() : anonymous_namespace{edsam.cpp}
• setup_edvec() : anonymous_namespace{edsam.cpp}
• setupAndRunInstance() : gmx
• setupDomainLifetimeWorkload() : gmx
• setupDynamicPairlistPruning() : gmx
• setupForceOutputs() : gmx
• setupGpuShortRangeWorkLow() : gmx
• setupInteractionConst() : gmx , gmx::test::anonymous_namespace{kernel_test.cpp}
• setupLocalGpuForceReduction() : gmx
• setupMtsLevels() : gmx
• setupNbnxmForBenchInstance() : gmx , gmx::test::anonymous_namespace{kernel_test.cpp}
• setupNonLocalGpuForceReduction() : gmx
• setupStepWorkload() : gmx
• setZero() : gmx
• setZeroD() : gmx
• setZeroDI() : gmx
• setZeroF() : gmx
• setZeroFI() : gmx
• sfree_wrapper() : gmx
• shift_positions() : gmx
• shiftAtoms() : gmx
• shiftIndexToXDim() : gmx
• shouldDoComparison() : gmx::test
• simd4SetZeroD() : gmx
• simd4SetZeroF() : gmx
• simdCheck() : gmx
• simdLoad() : gmx
• simdLoadU() : gmx
• simdPrefetch() : gmx
• simdSuggested() : gmx
• simplePropagationParameters() : gmx::test
• simpleValueToString() : gmx
• sin() : gmx
• sincDerivative() : gmx::test::anonymous_namespace{splinetable.cpp}
• sincFunction() : gmx::test::anonymous_namespace{splinetable.cpp}
• sincos() : gmx
• sincosSingleAccuracy() : gmx
• sinSingleAccuracy() : gmx
• sixthroot() : gmx
• sleepForMilliseconds() : gmx::test::anonymous_namespace{timing.cpp}
• someInteractionsCanRunOnGpu() : gmx
• sort_atoms() : gmx
• sort_cluster_on_flag() : gmx
• splitAndAddValues() : gmx::test
• splitAndTrimDelimitedString() : gmx
• splitDelimitedString() : gmx
• splitPathElements() : gmx::anonymous_namespace{keyvaluetree.cpp}
• splitPathEnvironment() : gmx
• splitString() : gmx
• spreadBondForces() : anonymous_namespace{bonded.cpp}
• spreadForceForThread() : gmx
• spreadForceWrapper() : gmx
• spreadRangeWithinLattice() : gmx
• sqrt() : gmx
• sqrtSingleAccuracy() : gmx
• square() : gmx
• ssize() : gmx
• startsListItem() : gmx::anonymous_namespace{rstparser.cpp}
• startsTable() : gmx::anonymous_namespace{rstparser.cpp}
• startsWith() : gmx
• stepInMultiDimArray() : gmx::anonymous_namespace{biasgrid.cpp}
• store() : gmx
• store4() : gmx
• store4U() : gmx
• storeDualHsimd() : gmx
• storeU() : gmx
• stringIdentityTransformWithArrayCheck() : gmx
• stringMatches() : gmx::test
• stripExtension() : gmx
• stripSourcePrefix() : gmx
• stripString() : gmx
• stripSuffixIfPresent() : gmx
• subgridToGridIndex() : gmx::anonymous_namespace{biasgrid.cpp}
• subtractElementwise() : gmx
• sumHistograms() : gmx::anonymous_namespace{biasstate.cpp}
• sumOverSimulations() : gmx
• sumPmf() : gmx::anonymous_namespace{biasstate.cpp}
• supportsDynamicPairlistGenerationInterval() : gmx
• swap() : gmx
• swap_header() : gmx
• swapEndian() : gmx::anonymous_namespace{inmemoryserializer.cpp}
• syclEnqueueCustomOp() : gmx
• syclSubmitWithoutEvent() : gmx
• systemHasConstraintsOrVsites() : gmx